Diplomová práce

Analýza interakcí fágů Staphylococcus epidermidis s hostitelskými buňkami

Analysis of interactions of Staphylococcus epidermidis phages with host cells

Bc. Kristína Rovňáková, učo 473959
Anotace

Staphylococcus epidermidis je obvykle komenzální bakterie, která však jako oportunistický patogen může způsobovat onemocnění, jež jsou kvůli rozšířené antibiotické rezistenci těžce léčitelná. Tento bakteriální druh také slouží jako rezervoár horizontálně šiřitelných genů rezistence pro jiné patogenní druhy, zejména Staphylococcus aureus. Mírné fágy rodu Phietavirus hrají důležitou roli v horizontálním …více

Abstract

Staphylococcus epidermidis is a commensal bacterium, which can act as an opportunistic pathogen and cause diseases that are difficult to treat due to widespread antibiotic resistance. These bacterial species also serves as a reservoir for horizontally spread genes for other pathogenic species, mainly Staphylococcus aureus. Temperate phages of Phietavirus genus play a crucial role in horizontal gene …více

Zadání práce
Vzhledem k podobnostem napříč mírnými fágy rodu Phietavirus bakteriálních druhů Staphylococcus epidermidis a Staphylococcus aureus se předpokládá, že tyto fágy hrají významnou roli v horizontálním přenosu genů mezi jejich hostiteli. Cílem práce bude sledovat interakce mírných fágů S. epidermidis s buňkami různých kmenů S. epidermidis a S. aureus, se zaměřením na schopnost transdukce mobilních genetických elementů napříč kmeny jednoho druhu i rodu. Studována bude interakce fágem indukovatelných chromozomálních ostrovů (PICI) s infikujícími bakteriofágy i profágy. Pomocí mikrobiologických a molekulárně-biologických technik bude u studovaných fágů stanoveno rozmezí hostitele a účinnost fágové infekce s ohledem na přítomnost PICI v genomu hostitele, a dále schopnost fágů a indukovaných profágů mobilizovat a transdukovat PICI a plazmidy. Zjištěné vlastnosti fágů a PICI budou dány do souvislosti s jejich genomikou. V průběhu řešení práce si student osvojí metody kultivace hostitelských bakterií, pomnožení bakteriofágů, testování fágového lyzátu plakovou metodou, stanovení rozmezí hostitele, transdukci s využitím selekce pomocí antibiotik, bioinformatické metody predikce mobilních genetických elementů a funkce genů, metody izolace bakteriální a fágové DNA, real-time qPCR, sekvenaci a další.
Práce zkontrolována:
3. 1. 2023 13:10, Mgr. Tibor Botka, Ph.D., učo 177238
Plný text práce
3,6 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
7. 2. 2023
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Tibor Botka, Ph.D., učo 177238
Genet ÚEB Biol PřF MU

Oponent

Mgr. Martin Benešík, Ph.D.
Mikrob ÚEB Biol PřF MU

Konzultant

Mgr. Ivana Mašlaňová, Ph.D., učo 106011
Genet ÚEB Biol PřF MU

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.