Faecalibacterium prausnitzii patří mezi významné komensální butyrát-produkující bakterie, které jsou spojovány se zdravým střevním mikrobiomem a protizánětlivými účinky. U pacientů s Barrettovým jícnem a adenokarcinomem jícnu může být přítomnost a množství této bakterie ovlivněno nejen samotným onemocněním, ale také např. užíváním léčiv ze skupiny inhibitorů protonové pumpy.

Cílem bakalářské práce bude i) provést literární rešerši k výběru optimálního cílového genu pro specifickou detekci F. prausnitzii, ii) navrhnout primery a sondu pro kvantitativní stanovení F. prausnitzii, iii) laboratorně ověřit navržené primery/sondu a optimalizovat podmínky qPCR a iv) aplikovat metodu na klinické vzorky a vyhodnotit získaná data. Student/ka provede tuto práci v rámci stáže v Laboratořích analýzy mikrobiomu ve Výzkumné infrastruktuře RECETOX.