Diplomová práce

Zkoumání vlivu pH na aktivitu expansinů a jejich lokalizace v buněčné stěně Arabidopsis thaliana.

Investigation of the influence of pH on the activity of expansins and their localization in the cell wall of Arabidopsis thaliana.

Bc. Dominik Šimko, učo 515516
Anotace

Expanzíny sú proteíny, ktoré zohrávajú kľúčovú úlohu pri rozvoľňovaní bunkovej steny (BS) rastlín, čo im umožňuje rásť a diferencovať sa. Aktivácia expanzínov závisí od acidifikácie BS, ktorú možno vyvolať rôznymi podnetmi vrátane rastlinných hormónov. Nedávne štúdie ukázali, že nadmerná expresia expanzínov môže mať neočakávané negatívne dôsledky na rast rastlín. Cieľom experimentálnej časti tejto …více

Abstract

Expansins are proteins that play a key role in loosening the cell wall (CW) of plants, allowing them to grow and differentiate. The activation of expansins is dependent on CW acidification, which can be induced by a variety of stimuli, including plant hormones. Recent studies have shown that overexpression of expansins can have unexpected negative consequences on plant growth. The experimental part …více

Zadání práce
Expansiny tvoří rozsáhlou skupinu proteinů, které rozvolňují buněčnou stěnu rostlin a umožňují tak jejich růst a diferenciaci. Expansiny jsou aktivovány okyselováním buněčné stěny, které může být vyvoláno řadou podnětů, včetně rostlinných hormonů. Expansiny byly poprvé lokalizovány in vivo do buněčné stěny za pomoci translační fúze s fluorescenčním proteinem mCherry, avšak jejich overexprese měla nečekaně negativní vliv na růst rostlin. Cílem diplomové práce bude i) vypracovat literární rešerši zabývající se aktivitou expansinů v závislosti na pH buněčné stěny, ii) měření pH in vivo v kořeni semenáčků Arabidopsis a jeho změny po aktivaci protonových pump, iii) přesněji lokalizovat expansiny v buněčné stěně modelové rostliny Arabidopsis thaliana. V rámci diplomové práce bude využito nejmodernějších zobrazovacích technik, jako je konfokální laserově skenovací mikroskopie (CLSM) a super-rezoluční nanoskopie, ve spolupráci s Core Facility Cellular Imaging (CELLIM, CEITEC MU).
Práce zkontrolována:
16. 5. 2025 10:54, doc. Mgr. Markéta Šámalová, Ph.D., učo 8937
Plný text práce
2,5 MB / soubor PDF
Jazyk práce
slovenština slovenština
Termín obhajoby
18. 6. 2025
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. Mgr. Markéta Šámalová, Ph.D., učo 8937
Rostl ÚEB Biol PřF MU

Oponent

doc. Mgr. Markéta Šámalová, Ph.D., učo 8937

Konzultant

Mgr. Jakub Pospíšil, Ph.D., učo 357959
CELLIM MCGPR CEITEC MU

Literatura

  • ŠÁMALOVÁ, Markéta; Alesia MELNIKAVA; Kareem ELSAYAD; Alexis PEAUCELLE; Evelína GAHUROVÁ; Jaromír GUMULEC; Ioannis SPYROGLOU; Elena V ZEMLYANSKAYA; Elena V UBOGOEVA; Darina BALKOVÁ; Martin DEMKO; Nicolas BLAVET; Panagiotis ALEXIOU; Vladimir BENES; Gregory MOUILLE a Jan HEJÁTKO. Hormone-regulated expansins: Expression, localization, and cell wall biomechanics in Arabidopsis root growth. Plant Physiology. CARY: OXFORD UNIV PRESS INC, 2024, roč. 194, č. 1, s. 209-228. ISSN 0032-0889. Dostupné z: https://doi.org/10.1093/plphys/kiad228.

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.