Bakalářská práce

Telomer-vazebné proteiny a jejich subcelulární funkce

Telomere-binding proteins and their subcellular function

Alžbeta Kusová
Anotace

Teloméry sú nukleoproteínové štruktúry nachádzajúce sa na koncoch lineárnych eukaryotických chromozómov. V oblasti telomér sa nachádza enzým telomeráza, ktorý je tvorený dvomi podjednotkami: telomerázovou RNA (TR) a telomerázovou reverznou transkriptázou (TERT). Jeho hlavnou úlohou je ochrana a predlžovanie telomér. Avšak predpokladá sa, že telomeráza má i mnoho netelomerických funkcií spojených napríklad …více

Abstract

Telomeres are nucleoprotein structures situated at the end of linear eukaryotic chromosomes. The telomerase enzyme is localised in proximity to telomeres and is composed of two subunits: telomerase RNA (TR) and telomerase reverse transcriptase (TERT). The main function of telomerase is the protection and elongation of telomeres. However, it is assumed that telomerase has also some non-telomeric functions …více

Klíčová slova
teloméry telomeráza telomér-väzbové proteíny TRB proteíny Arabidopsis thaliana Physcomitrella patens kríženie telomeres telomerase telomere-binding proteins TRB proteins cross
Zadání práce
Telomery jsou nukleoproteinové struktury lokalizované na koncích lineárních eukaryotických chromozomů, které jsou u savců chráněny komplexem proteinů zvaným „Shelterin“. V nedávné době byly, také díky naší laboratoři, popsány jedny z prvních proteinů asociovaných s rostlinnými telomerickými sekvencemi (Telomere repeat binding - TRB) (Schrumpfova et al. 2004; Mozgova et al. 2008; Schrumpfova et al. 2014; Arora et al. 2016; Dreissing et al., 2017). Tyto proteiny však kromě přímé asociace s fyzickými konci chromosomů, zastávají v rostlinných buňkách i jiné funkce – jsou asociovány s promotorovými sekvencemi genů zapojených v transkripční/translační mašinérii či jsou asociovány s proteiny, které se mohou podílet na skládání telomerázy (Schrumpfova, Vychodilova et al. 2016; Zhou, Hartwig et al. 2016, shrnuto v Prochazkova Schrumpfova, Schorova et al. 2016). V rámci bakalářské práce bude provedeno křížení rostlin mutantních pro některé z proteinů zapojených do regulace délky telomer. Také se bude studentka podílet na analýzách týkajících se detailnější charakterizace telomerické či netelomerické funkce proteinů asociovaných s telomerami či telomerázou. Arora, A., M. A. Beilstein, et al. (2016). Nucleic Acids Res. 16;44(20):9821-9830 Dreissig, S., Schiml, S., et al. (2017), Plant J., 91(4): 565–573. Mozgova, I., P. P. Schrumpfova, et al. (2008). Phytochemistry 69(9): 1814-1819. Schrumpfova, P., M. Kuchar, et al. (2004).." Genome 47(2): 316-324. Schrumpfova, P. P., I. Vychodilova, et al. (2014). Plant J 77(5): 770-781. Schrumpfova, P. P., I. Vychodilova, et al. (2016). Plant Mol Biol 90(1-2): 189-206. Schrumpfova, P.P., S. Schorova, et al. (2016). Front Plant Sci 7: 851. Zhou, Y., B. Hartwig, et al. (2016). Plant Cell 28(1): 87-101
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
15. 5. 2018 10:30, doc. Mgr. Petra Procházková Schrumpfová, Ph.D., učo 12987
Plný text práce
1,8 MB / soubor PDF
Jazyk práce
slovenština slovenština
Termín obhajoby
12. 6. 2018
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. Mgr. Petra Procházková Schrumpfová, Ph.D., učo 12987
NCBR PřF MU

Oponent

Mgr. Radka Dopitová, Ph.D., učo 12868
CF BIC CSB CEITEC MU

Konzultant

Mgr. Šárka Schořová, Ph.D.
NCBR PřF MU

Literatura

  • SCHRUMPFOVÁ, Petra; Milan KUCHAŘ; Gabriela ROTKOVÁ; Lenka SKŘÍŠOVSKÁ; Tatiana KUBIČÁROVÁ a Jiří FAJKUS. Characterization of two Arabidopsis thaliana myb-like proteins showing affinity to telomeric DNA sequence. Genome. CANADA: NATL RESEARCH COUNCIL CANADA, 2004, roč. 47, March 2004, s. 316-324. ISSN 0831-2796.
  • MOZGOVÁ, Iva; Petra PROCHÁZKOVÁ SCHRUMPFOVÁ; Ctirad HOFR a Jiří FAJKUS. Functional characterization of domains in AtTRB1, a putative telomere-binding protein in Arabidopsis thaliana. Phytochemistry. England: Pergamon-Elsevier Science Ltd, 2008, roč. 69, č. 9, s. 1814-1819. ISSN 0031-9422.
  • PROCHÁZKOVÁ SCHRUMPFOVÁ, Petra; Milan KUCHAŘ; Jan PALEČEK a Jiří FAJKUS. Mapping of interaction domains of putative telomere-binding proteins AtTRB1 and AtPOT1b from Arabidopsis thaliana. FEBS LETT. Netherlands: Elsevier Science BV, 2008, roč. 582, č. 10, s. 1400-1406. ISSN 0014-5793.
  • PROCHÁZKOVÁ SCHRUMPFOVÁ, Petra; Ivona VYCHODILOVÁ; Martina DVOŘÁČKOVÁ; Jana MAJERSKÁ; Ladislav DOKLÁDAL; Šárka SCHOŘOVÁ a Jiří FAJKUS. Telomere repeat binding proteins are functional components of Arabidopsis telomeres and interact with telomerase. The Plant Journal. Hoboken (USA): Blackwell Science, 2014, roč. 77, č. 5, s. 770-781. ISSN 0960-7412. Dostupné z: https://doi.org/10.1111/tpj.12428.
  • PROCHÁZKOVÁ SCHRUMPFOVÁ, Petra; Ivona STRAŽICKÁ; Jan HAPALA; Šárka SCHOŘOVÁ; Vojtěch DVOŘÁČEK a Jiří FAJKUS. Telomere binding protein TRB1 is associated with promoters of translation machinery genes in vivo. Plant Molecular Biology. Dordrecht: SPRINGER, 2016, roč. 90, 1-2, s. 189-206. ISSN 0167-4412. Dostupné z: https://doi.org/10.1007/s11103-015-0409-8.
  • PROCHÁZKOVÁ SCHRUMPFOVÁ, Petra; Šárka SCHOŘOVÁ a Jiří FAJKUS. Telomere- and Telomerase-Associated Proteins and Their Functions in the Plant Cell. Frontiers in Plant Science. Lausanne: Frontiers Media SA, 2016, roč. 7, June, s. nestránkováno, 19 s. ISSN 1664-462X. Dostupné z: https://doi.org/10.3389/fpls.2016.00851.
  • MAJERSKÁ, Jana; Petra PROCHÁZKOVÁ SCHRUMPFOVÁ; Ladislav DOKLADAL; Šárka SCHOŘOVÁ; Karel STEJSKAL; Michal OBOŘIL; David HONYS; Lucie KOZÁKOVÁ; Pavla SOVÁKOVÁ a Eva SYKOROVA. Tandem affinity purification of AtTERT reveals putative interaction partners of plant telomerase in vivo. Protoplasma. Wien: Springer-Verlag, 2017, roč. 254, č. 4, s. 1547-1562. ISSN 0033-183X. Dostupné z: https://doi.org/10.1007/s00709-016-1042-3.
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biochemie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.