Bakalářská práce

Charakterizace funkce proteinů zapojených do regulace délky telomer

Characterization of the function of the proteins involved in the telomere length regulation

Ľudmila Richweissová
Anotace

Teloméry sú komplexné štruktúry zložené z DNA a proteínov nachádzajúce sa na koncoch lineárnych chromozómov. Sú dôležité pri ochrane koncov chromozómov, zabezpečujú ich odlíšenie od dvojvláknových zlomov DNA . Na udržiavaní dĺžky telomér sa podieľa enzým telomeráza, ktorý je tvorený dvomi podjednotkami: telomerázovou RNA (TR) a telomerázovou reverznou transkriptázou (TERT). Ak enzým telomeráza nie …více

Abstract

Telomeres are complex structures composed of DNA and proteins located at the ends of linear chromosomes . They are important in protecting the ends of chromosomes, ensuring that they are distinguished from double-stranded DNA breaks. Telomerase enzyme, which consists of two subunits: telomerase RNA (TR) and telomerase reverse transcriptase (TERT), is involved in maintaining telomere length. If the …více

Klíčová slova
Arabidopsis thaliana teloméry telomeráza telomér-väzbové proteíny TRB proteíny kríženie kvasinkový dvojhybridný systém telomeres telomerase telomere-binding proteins crossing yeast two-hybrid system
Zadání práce
Konce eukaryotických chromosomů (telomery) nejsou rozpoznány jako dvouvláknové zlomy díky celé řadě interagujících proteinů. Tento komplex proteinů je u člověka nazván "Shelterin" a proteiny podobné proteinům komplexu Shelterinu byly, také díky naší laboratoři, v nedávné době popsány i u rostlin (Schrumpfova et al., 2004, Schrumpfova et al. 2014; Dreissing et al., 2017). U jednoho z těchto proteinů (Telomere Repeat Binding - TRB) bylo v nedávné době prokázáno, že kromě telomer, je schopen vázat také promotory genů, které jsou spjaty s translační mašinérií (Schrumpfova et al. 2016) a nejspíše se podílí na regulaci transkripce (Zhou et al. 2016, shrnuto v review Schrumpfova et al. 2016). Tyto data naznačují, že TRB proteiny, stejně jako enzym Telomeráza (podílí se na prodlužování telomer) není pouze asociován s fyzickými konci chromosomů, ale podílí se i na regulaci celé řady netelomerických procesů. V rámci bakalářské práce bude provedeno křížení rostlin mutantních pro některé z proteinů zapojených do regulace délky telomer. Také se bude studentka podílet na analýzách týkajících se detailnější charakterizace telomerické či netelomerické funkce proteinů asociovaných s telomerami či telomerázou. Arora, A., M. A. Beilstein, et al. (2016). Nucleic Acids Res. 16;44(20):9821-9830 Dreissig, S., Schiml, S., et al. (2017), Plant J., 91(4): 565–573. Mozgova, I., P. P. Schrumpfova, et al. (2008). Phytochemistry 69(9): 1814-1819. Schrumpfova, P., M. Kuchar, et al. (2004).." Genome 47(2): 316-324. Schrumpfova, P. P., I. Vychodilova, et al. (2014). Plant J 77(5): 770-781. Schrumpfova, P. P., I. Vychodilova, et al. (2016). Plant Mol Biol 90(1-2): 189-206. Schrumpfova, P.P., S. Schorova, et al. (2016). Front Plant Sci 7: 851. Zhou, Y., B. Hartwig, et al. (2016). Plant Cell 28(1): 87-101.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
15. 5. 2019 13:34, doc. Mgr. Petra Procházková Schrumpfová, Ph.D., učo 12987
Plný text práce
1,4 MB / soubor PDF
Jazyk práce
slovenština slovenština
Termín obhajoby
25. 6. 2019
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. Mgr. Petra Procházková Schrumpfová, Ph.D., učo 12987
NCBR PřF MU

Oponent

doc. Mgr. Jan Paleček, Dr. rer. nat., učo 38623

Konzultant

Mgr. Šárka Schořová, Ph.D.
NCBR PřF MU

Literatura

  • SCHRUMPFOVÁ, Petra; Milan KUCHAŘ; Gabriela ROTKOVÁ; Lenka SKŘÍŠOVSKÁ; Tatiana KUBIČÁROVÁ a Jiří FAJKUS. Characterization of two Arabidopsis thaliana myb-like proteins showing affinity to telomeric DNA sequence. Genome. CANADA: NATL RESEARCH COUNCIL CANADA, 2004, roč. 47, March 2004, s. 316-324. ISSN 0831-2796.
  • MOZGOVÁ, Iva; Petra PROCHÁZKOVÁ SCHRUMPFOVÁ; Ctirad HOFR a Jiří FAJKUS. Functional characterization of domains in AtTRB1, a putative telomere-binding protein in Arabidopsis thaliana. Phytochemistry. England: Pergamon-Elsevier Science Ltd, 2008, roč. 69, č. 9, s. 1814-1819. ISSN 0031-9422.
  • PROCHÁZKOVÁ SCHRUMPFOVÁ, Petra; Milan KUCHAŘ; Jan PALEČEK a Jiří FAJKUS. Mapping of interaction domains of putative telomere-binding proteins AtTRB1 and AtPOT1b from Arabidopsis thaliana. FEBS LETT. Netherlands: Elsevier Science BV, 2008, roč. 582, č. 10, s. 1400-1406. ISSN 0014-5793.
  • PROCHÁZKOVÁ SCHRUMPFOVÁ, Petra; Ivona VYCHODILOVÁ; Martina DVOŘÁČKOVÁ; Jana MAJERSKÁ; Ladislav DOKLÁDAL; Šárka SCHOŘOVÁ a Jiří FAJKUS. Telomere repeat binding proteins are functional components of Arabidopsis telomeres and interact with telomerase. The Plant Journal. Hoboken (USA): Blackwell Science, 2014, roč. 77, č. 5, s. 770-781. ISSN 0960-7412. Dostupné z: https://doi.org/10.1111/tpj.12428.
  • PROCHÁZKOVÁ SCHRUMPFOVÁ, Petra; Ivona STRAŽICKÁ; Jan HAPALA; Šárka SCHOŘOVÁ; Vojtěch DVOŘÁČEK a Jiří FAJKUS. Telomere binding protein TRB1 is associated with promoters of translation machinery genes in vivo. Plant Molecular Biology. Dordrecht: SPRINGER, 2016, roč. 90, 1-2, s. 189-206. ISSN 0167-4412. Dostupné z: https://doi.org/10.1007/s11103-015-0409-8.
  • PROCHÁZKOVÁ SCHRUMPFOVÁ, Petra; Šárka SCHOŘOVÁ a Jiří FAJKUS. Telomere- and Telomerase-Associated Proteins and Their Functions in the Plant Cell. Frontiers in Plant Science. Lausanne: Frontiers Media SA, 2016, roč. 7, June, s. nestránkováno, 19 s. ISSN 1664-462X. Dostupné z: https://doi.org/10.3389/fpls.2016.00851.
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biochemie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.