Disertační práce

Proteiny spojené s oxidačním stresem u bakterie Paracoccus denitrificans

Oxidative stress-linked proteins in the bakterium Paracoccus denitrificans

Mgr. Martin Kryl
Anotace

ArsH flavinreduktasa Paracoccus denitrificans PD1222 kódovaná genem pden_3133 byla připravena jako N terminálně značený konstrukt a purifikovaný protein byl krystalizován v uspořádání sedící kapky. Difrakce byla dosažena na 2,6 Å a struktura byla řešitelná molekulárním přenesením. Krystaly patří do prostorové skupiny 154 s asymetrickou jednotkou sestávající z dimeru dimerů s následujícími parametry …více

Abstract

ArsH flavinreductase of Paracoccus denitrificans PD1222 encoded by gene pden_3133 was prepared as N terminally taged construct and purified protein was crystalized in sitting drop arrangement. Diffraction of 2,6 Å was acheived and the structure was solvable via molecular replacement. Crystals belong to spacegroup 154 with unit cell consisting of dimer mof dimers with following parameters a, b, c (Å …více

Klíčová slova
RTG krystalografie flavinreduktasa Paracoccus denitrificans ArsH Pden_5119 protein X ray crystalography flavinreductasa
Zadání práce
Disertační práce tematicky navazuje na proteomickou studii (Pernikářová, V. et al., J. Proteomics 2015, 125, 68-75), ve které byly identifikovány proteiny, jejichž hladina se v bakteriálních buňkách výrazně mění při oxidačním stresu. Jedná se o flavinreduktasy, potenciální flavin-dependentní monooxygenasy, enzymy fixace CO2 a proteiny regulované transkripčním faktorem FnrP. Disertace se zaměří na objasnění biologické funkce těchto proteinů kombinací následujících postupů: stanovení hladiny transkriptů mRNA v závislosti na podmínkách stresu, fenotypická charakterizace mutantních kmenů a biochemické studie proteinů získaných heterologní expresí příslušných genů.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
21. 8. 2023 08:14, prof. RNDr. Igor Kučera, DrSc., učo 911
Plný text práce
3,8 MB / soubor PDF
Přílohy (1)
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
5. 9. 2023
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. RNDr. Igor Kučera, DrSc., učo 911
ÚBioch Chem PřF MU

Oponenti

prof. RNDr. Ivana Kutá-Smatanová, Ph.D.
ext RECETOX PřF MU, PřF JČU, České Budějovice
prof. Mgr. Marek Petřivalský, Dr.
ext PřF MU, PřF UP v Olomouci

Konzultant

Mgr. Vojtěch Sedláček, Ph.D., učo 21931
ÚBioch Chem PřF MU

Literatura

  • SEDLÁČEK, Vojtěch; Rob VAN SPANNING a Igor KUČERA. Ferric reductase A is essential for effective iron acquisition in Paracoccus denitrificans. Microbiology-SGM. Reading, Berks (Great Britain): Society for General Microbiology, 2009, roč. 155, č. 4, s. 1294-1301, 7 s. ISSN 1350-0872.
  • SEDLÁČEK, Vojtěch; Rob VAN SPANNING a Igor KUČERA. Characterization of the quinone reductase activity of the ferric reductase B protein from Paracoccus denitrificans. Archives of biochemistry and biophysics. New York: Academic Press, 2009, roč. 483, č. 1, s. 29-36. ISSN 0003-9861.
  • SEDLÁČEK, Vojtěch a Igor KUČERA. Chromate reductase activity of the Paracoccus denitrificans ferric reductase B (FerB) protein and its physiological relevance. Archives of microbiology. Springer, 2010, roč. 192, č. 11, s. 919-926. ISSN 0302-8933.
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Biochemie

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.