Závěrečná práce: Michal Šimčák, učo 484620: Extracelulární přenos elektronů u baktérií
Bakalářská práce
Extracelulární přenos elektronů u baktérií
Extracellular electron transfer in bacteria
Anotace
Některé druhy bakterií si díky speciálním mechanismům dokážou vyměňovat elektrony s extracelulárními minerály a elektrodami, které fungují jako akceptory nebo donory elektronů. Mezi základní složky, které zprostředkovávají tento transport a jsou popsány v této práci, patří cytochromy typu c, vodivé nanodráty a elektronové přenašeče, které mají schopnost cirkulovat mezi buňkou a minerálem. Popsány byly …více
Abstract
Thanks to special mechanisms, certain types of bacteria are able to exchange electrons with extracellular minerals, which act as acceptors or electron donors. The basic components that mediate this transport and are described in this thesis include type C cytochromes, conductive nanowires and electron shuttles, which have the ability to circulate between the cell and the mineral. The potential uses …více
Zadání práce
Konverze energie na biologicky využitelnou formu v živých organismech je založena na oxidačně-redukčních reakcích (respirační a fotosyntetické řetězce přenosu elektronů, fermentace). Tyto procesy jsou podmíněny látkovou výměnou mezi buňkou a okolím a obvykle probíhají uvnitř buněk. U některých mikroorganismů byl ale prokázán i přímý přenos elektronů přes buněčnou stěnu mezi vnitřkem buňky a povrchem nerozpustného materiálu, se kterým je buňka v kontaktu (např. minerálem sloužícím jako donor nebo akceptor elektronů při respiraci, elektrodou nebo jinou buňkou). Důležitou úlohu zde hrají redoxaktivní proteiny, zejména multihemové cytochromy, které zprostředkují tok elektronů na vzdálenost řádově 10 nm. Elektroaktivní mikroby mají potenciál využití v palivových článcích, bioelektrochemicky podporovaných mikrobiálních reaktorech, při bioremediaci toxických kovů, bioloužení kovů z rud a pro konstrukci nových senzorů a bioelektronických zařízení.Enzymy denitrifikační dráhy, která u bakterie Paracoccus denitrificans za anaerobních podmínek uskutečňuje redukci dusičnanu na dusík, se nacházejí v cytoplazmatické membráně a periplazmatickém prostoru. Potřebné redukční ekvivalenty jsou produkovány intracelulárními dehydrogenasami. Jiang et al. (Water Res. 2020, 169, 115242) nedávno ukázali, že společná kultivace P. denitrificans s elektroaktivní bakterií Shewanella oneidensis výrazně ovlivňuje průběh denitrifikace. Autoři předpokládají, že dochází ke kontaktu buněk obou kmenů a k přenosu elektronů přes buněčnou stěnu P. denitrificans k denitrifikačním enzymům. Podle jiného zjištění P. denitrificans může předávat elektrony anodě při oxidaci organického substrátu formiátu v mikrobiálním palivovém článku (Kiely et al., Appl. Microbiol. Biotechnol. 2010, 88, 371–380). Zdá se tedy, že P. denitrificans vykazuje některé rysy elektroaktivity.
Cíle práce:
- Shrnout současný stavu poznání mechanismů extracelulárního přenosu elektronů a podat přehled možných praktických využití.
- Testování vlivu vybraných externích elektronových donorů a akceptorů na aktivity denitrifikační dráhy bakterie Paracoccus denitrificans a provedení základní elektrochemická charakteristika suspenze a biofilmu této bakterie na elektrodě.
20. 5. 2022 06:10, prof. RNDr. Igor Kučera, DrSc., učo 911
Konzultant
Práce na příbuzné téma
Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
-
Purifikace a analýza mikrobiálních proteinů pomocí chromatografických a elektroforetických metod
Mgr. Radek Tesařík, Ph.D. -
Proteiny spojené s oxidačním stresem u bakterie Paracoccus denitrificans
Mgr. Martin Kryl, Ph.D. -
Oxidační stres u denitrifikačních bakterií
Mgr. Timotej Gajdošík -
Charakterizace proteinu kódovaného genem 4789 z bakterie Paracoccus denitrificans
Mgr. Martin Hamřík -
Modifikace kovových sítěk pro aplikaci v cryo-TEM
Mgr. Karolína Citterbardová -
Studium membránového transportu dusičnanu u bakterie Paracoccus denitrificans
Mgr. Miroslava Janů -
Metabolická odezva bakterie Paracoccus denitrificans na změny redoxního stavu prostředí
Mgr. Tereza Vyhlídalová -
Matabolomika
Mgr. Kateřina Černá Pilátová, Ph.D., učo 133352




