Bakalářská práce

Oxidační stres u denitrifikačních bakterií

Oxidative stress in denitrifying bacteria

Timotej Gajdošík
Anotace

Cyklus dusíku v přírodě je z nemalý míry ovlivňován denitrifikačními bakteriemi. Modelovým organismem studia tohoto procesu je Paracoccus denitrificans. Vzhledem na to, že se jedná o obligátně respirující bakterii, je její metabolismus zatížen oxidačním stresem. Ve předešlém výzkumu Pernkířová et al. 2015 byla tato bakterie vystavena zvýšenému oxidačnímu stresu a následní proteomická analýza ukázala …více

Abstract

The nitrogen cycle in nature is in no small part influenced by denitrification bacteria. The model organism for studying this process is Paracoccus denitrificans. Due to the fact that it is an obligatory respirating bacteria, its metabolism is under strain from oxidative stress. In a previous research by Pernkířová et al. 2015 this bacteria was put under increased oxidative stress and a following proteomic …více

Zadání práce
Bakterie Paracoccus denitrificans je obligátně respirující (nefermentující), což způsobuje, že její buňky jsou kontinuálně vystaveny oxidačnímu stresu. V dřívější proteomické studii (Perníkářová et al. 2015) bylo zjištěno, že zvýšený oxidační stres navozený přídavkem methylviologenu vede ke zvýšení hladiny některých proteinů, jež by mohly hrát úlohu v obraně buňky proti stresu. Na základě těchto poznatků byly zkonstruovány mutantní kmeny, u nichž se očekává změna fyziologické odpovědi na stres. Bakalářské práce v teoretickém úvodu stručně shrne současné poznatky o vzniku reaktivních forem kyslíku u bakterií a o bakteriálních antioxidačních systémech. Podrobněji se bude věnovat bakterii P. denitrificans a teorii vyhodnocení turbidimetrických růstových křivek. V praktické části budou provedeny růstové studie s divokým kmenem a mutanty s defektními geny regA , regB a 5119. Růst bude studován za aerobních podmínek v přítomnosti různých koncentrací methylviologenu. Bude též testován vliv použitého zdroje uhlíku (sukcinát, methanol, formiát).
Práce zkontrolována:
15. 5. 2018 05:44, prof. RNDr. Igor Kučera, DrSc., učo 911
Plný text práce
1,8 MB / soubor PDF
Jazyk práce
slovenština slovenština
Termín obhajoby
12. 6. 2018
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. RNDr. Igor Kučera, DrSc., učo 911
ÚBioch Chem PřF MU

Oponent

doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D., učo 8757
ÚBioch Chem PřF MU

Konzultant

Mgr. Vojtěch Sedláček, Ph.D., učo 21931
ÚBioch Chem PřF MU

Literatura

  • PERNIKÁŘOVÁ, Vendula; Vojtěch SEDLÁČEK; David POTĚŠIL; Iva PROCHÁZKOVÁ; Zbyněk ZDRÁHAL; Pavel BOUCHAL a Igor KUČERA. Proteomic responses to a methyl viologen-induced oxidative stress in the wild type and FerB mutant strains of Paracoccus denitrificans. Journal of Proteomics. Amsterdam: ELSEVIER SCIENCE BV, 2015, roč. 125, July, s. 68-75. ISSN 1874-3919. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.jprot.2015.05.002.

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.