Interakce protilátek a antigenů budou studovány na dvou úrovních. Pomocí afinitních biosensorů bude sledován vznik imunokomplexů a jejich kinetika na povrchu vhodného převodníku (piezosensor, plasmonová rezonance, elektrochemie). Získané poznatky pak budou využity při vývoji a použití různých typů imunosensorů, které budou testovány i pro reálné aplikace. Imobilizace imunoreagencií a vytváření měřících zón (spotů) bude realizováno kovalentní vazbou, případně využitím techniky ink-jet depozice. Druhým přístupem bude studium na molekulární úrovni technikami mikroskopie na bázi atomových sil (AFM), kdy bude sledována silová interakce mezi jednotlivými molekulami na hrotu AFM raménka a sledovaným vzorkem. Mimo to AFM poslouží i pro klasické zobrazení imunokomplexů, případně včetně vytváření afinitních map povrchu imunosensorů. Mezi studované biologické objekty budou zahrnuty molekuly haptenů, proteinových antigenů i mikrobiální a eukaryotické buňky.