Diplomová práce

Úloha cílových molekul miRNA v biologii solidních nádorů a hematologických malignit

The role of miRNA targets in the biology of solid and haematological malignancies.

Bc. Kateřina Henzlová
Anotace

MicroRNA jsou důležité regulátory genové exprese na post-transkripční úrovni, jejichž deregulace byla popsána u mnoha solidních nádorů i hematologických malignit. Diplomová práce se zaměřuje na úlohu miR-150 a miR-155 u kolorektálního karcinomu, jejich souvislost s prognózou, asociaci s klinickými charakteristikami nemoci a mechanismus působení.

Abstract

MicroRNA's are important regulators of gene expression at post transcriptional level and their deregulation has been described in many solid tumours and hematologic malignancies. This diploma thesis is focused on the role of miR-150 and miR-155 in colorectal cancer pathogenesis, their association with prognosis and clinical features and also mechanism of action.

Zadání práce
MicroRNA (miRNA) jsou krátké nekódující molekuly RNA o délce kolem 20 nukleotidů, které fungují jako důležité regulátory genové exprese na post-transkripční úrovni. MicroRNA mohou regulovat až polovinu všech protein-kódujících genů a hrají důležitou úlohu v mnoha biologických procesech zahrnujících proliferaci, diferenciaci, apoptózu či vývoj imunitního systému. Deregulace exprese miRNA byla popsána u solidních nádorů a hematologických malignit, ale jejich funkce zůstává většinově neobjasněna. Diplomová práce se bude zabývat analýzou úlohy vybraných miRNA (miR-150, miR-155, miR-34a a dalších) v molekulárních drahách u B-buněčných malignit a u kolorektálního karcinomu. V případě B buněčných malignit jsme popsali, že zmíněné miRNA regulují klíčovou dráhu signalizace přes B buněčný receptor (BCR), která je základním regulátorem vývoje a fyziologie B buněk (Mraz et al, Blood, 2014, Cui et al., Blood, 2014, Mraz and Kipps, Leuk Lymph, 2013). Zároveň, ale není jasné zcela, které další cílové dráhy jsou těmito miRNA řízeny. Je zajímavé, že stejné miRNA jsou potenciálně asociovány také s agresivitou solidních tumorů, které nemají dráhu BCR. Pokusíme se s využitím souboru cca 60 pacientů s kolorektálním karcinomem a cca 100 pacientů s B buněčnými malignitami a popsat, které další molekulární dráhy a které cílové mRNA jsou regulovány zmíněnými miRNA (a případně dalšími miRNA), především s ohledem na posun cílů u zcela rozdílných buněčných typů (B- vs kolorektální- buňky). Bude testována souvislost jejich exprese s prognózou pacientů, klinicko-biologickými charakteristikami a bude využito buněčných linií k popsání jejich funkčního významu (pomocí siRNA, miRNA mimic a inhibitorů, analýza pomoci immunoblutingu, detekce miRNA pomocí NGS a RT-PCR). Bude také zkoumán vliv přímé administrace terapie (in vitro a případně in vivo) na expresi miR-150, miR-155 a miR-34a.
Práce zkontrolována:
12. 5. 2017 04:37, prof. MUDr. Mgr. Marek Mráz, Ph.D., učo 101627
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
7. 6. 2017
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. MUDr. Mgr. Marek Mráz, Ph.D., učo 101627
Pracoviště výzkumu genomu Biol PřF MU

Oponent

Autor posudku dosud neidentifikován.

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.