Geny kódující ribosomální RNA (rDNA) jsou nezbytné ve všech buňkách pro zajištění produkce dostatečného množství proteinů. Na chromozomální úrovni u A. thaliana jsou tyto geny organizovány jako stovky opakujících se tandemových repetic na koncových částech chromozomů 2 a 4. Zatímco aktivní geny jsou organizovány v jadérku, inaktivní rDNA geny jsou koncentrovány do ohnisek přiléhajících k jadérku nebo nejsou s jadérkem vůbec asociovaný. Regulace transkripce rDNA a s ní související organizace jadérka je momentálně u rostlin do velké míry neznámá. Cílem bakalářské práce je využít bioinformatických databází pro pre-selekci kandidátních genů a proteinů které regulují fyziologii jadérka a následně tyto proteiny charakterizovat pomocí mikroskopických a biochemických metod. Z metodického hlediska bude práce zahrnovat základní postupy přípravy mikroskopických preparátů (izolace jader z rostlin, imunodetekce, fluorescenční in-situ hybridizace) a klonování vybraných proteinů pomocí metody Gateway, za využití vektorů pro přechodnou transformaci protoplastů.