Telomery, nukleoproteinové struktury lokalizované na koncích lineárních eukaryotických chromozómů, jsou klasicky charakterizovány jako heterochromatinové oblasti. Pilotní analýza struktury telomerového chromatinu v rostlině A. thaliana odhalila jejich duální charakter (na pomezí mezi euchromatinem a heterochromatinem), jiná studie dokonce charakterizovala telomery jako oblasti asociované s epigenetickými modifikacemi typickými pro euchromatin. Asymetricky lokalizované cytosiny v C-bohatém řetězci rostlinných telomer mohou být navíc methylované, protože rostlinné buňky disponují enzymatickým aparátem schopným methylovat cytosiny i mimo dublety CpG. Případný funkční význam methylace telomerových cytosinů a modifikací telomerových histonů rostlin je dosud neznámý. Náplní diplomové práce bude analýza hypomethylovaných rostlin A. thaliana a N. tabacum a buněčné kultury tabáku BY-2. Budou použity mutantní rostliny A. thaliana s nefunkčními geny kódujícími proteiny, které jsou nezbytné pro udržení stabilního methylačního obrazu (mutanty met1 a ddm1), rostliny A. thaliana a N. tabacum klíčené v přítomnosti hypomethylačních látek a kultura BY-2 pěstovaná v přítomnosti hypomethylačních látek. Telomery hypomethylovaných rostlin A. thaliana jsou zkrácené, zatímco u kultury BY-2 kultivované v přítomnosti hypomethylačních látek se délka telomer nezměnila. Bude zopakována analýza délky telomer a bude analyzováno množství telomerových transkriptů TERRA a epigenetické modifikace telomerových histonů. Literatura: Ogrocká A, Polanská P, Majerová E, Janeba Z, Fajkus J, Fojtová M. Compromised telomere maintenance in hypomethylated Arabidopsis thaliana plants. Nucleic Acids Res 2014, 42, 2919-2931. Majerová E, Fojtová M, Mozgová I, Bittová M, Fajkus J. Hypomethylating drugs efficiently decrease cytosine methylation in telomeric DNA and activate telomerase without affecting telomere lengths in tobacco cells. Plant Mol Biol 2011, 77, 371-380. Fojtová M, Fajkus J. Epigenetic regulation of telomere maintenance. Cytogenet Genome Res 2014, doi:10.1159/000360775. Majerová E, Mandaková T, Wu GTH, Fajkus J, Lysák M, Fojtová M. Epigenetic features of plant telomeric chromatin at terminal versus internal positions. submitted Vrbsky J, Akimcheva S, Watson JM, Turner TL, Daxinger L, Vyskot B, Aufsatz W, Riha K. siRNA-mediated methylation of Arabidopsis telomeres. PLoS Genet 2010, e1000986. Vaquero-Sedas MI, Gamez-Arjona FM, Vega-Palas MA. Arabidopsis thaliana telomeres exhibit euchromatic features. Nucleic Acids Res 2011, 39, 2007-2017.