Diplomová práce

Funkční význam epigenetické modifikace H3K27me3 na rostlinných telomerových histonech

Functional relevance of the H3K27me3 epigenetic mark at plant telomeric histones

Bc. Veronika Rájecká, učo 408661
Anotace

Epigenetika je vědní obor studující změny exprese genů, obecně změny struktury chromatinu, které nesouvisí se změnami sekvence DNA, ale jsou realizovány např. kovalentními modifikacemi bází DNA a histonů. Těmto regulacím podléhají i telomery, nukleoproteinové struktury na koncích lineárních eukaryotických chromosomů s ochrannou funkcí. Telomerová repetice TTTAGGG je kanonickou repetitivní sekvencí …více

Abstract

Epigenetics is focused on the study of changes of gene expression levels (generally changes of chromatin structure) which are not determined by the changes of the DNA sequence but are realized via e.g. covalent modifications of DNA and histones. Telomeres, nucleoprotein structures at the ends of linear eukaryotic chromosomes, are targets of these epigenetic regulations. Most of the plants, including …více

Klíčová slova
epigenetika modifikace histonů telomery telomerasa gen CURLY LEAF gen RELATIVE OF EARLY FLOWERING 6 epigenetics histone modifications telomeres telomerase CURLY LEAF gene RELATIVE OF EARLY FLOWERING 6 gene
Zadání práce
Telomery, nukleoproteinové komplexy na koncích lineárních eukaryotických chromozómů, jsou nezbytné pro integritu genomu. Analýza telomerového chromatinu v modelových rostlinách Arabidopsis thaliana (huseníček rolní) a Nicotiana tabacum (tabák viržinský) odhalila jeho duální charakter, s převahou epigenetických značek typických pro rostlinný heterochromatin. Poměrně překvapivá je přítomnost modifikace asociované převážně s vývojově umlčenými geny, H3K27me3. Funkční význam modifikací telomerových histonů rostlin je doposud neznámý. Náplní diplomové práce bude analýza mutantních rostlin A. thaliana nesoucích inzerci T-DNA v genech, které kódují enzymy katalyzující methylaci nebo demethylaci lyzinu v poloze 27 na histonu H3 (H3K27). Ve následných generacích mutantních rostlin bude analyzována délka telomer, aktivita a tranksripce telomerázy, a epigenetické modifikace telomerových histonů. Literatura: Dvořáčková M, Fojtová M, Fajkus J. Chromatin dynamics of plant telomeres and ribosomal genes. Plant J 2015, 83, 18-37. Fojtová M, Fajkus J. Epigenetic regulation of telomere maintenance. Cytogenet Genome Res 2014, 143, 125-135. Majerová E, Mandaková T, Wu GTH, Fajkus J, Lysák M, Fojtová M. Epigenetic features of plant telomeric chromatin at terminal versus internal positions. Front Plant Sci 2014, 5, 593. Ogrocká A, Polanská P, Majerová E, Janeba Z, Fajkus J, Fojtová M. Compromised telomere maintenance in hypomethylated Arabidopsis thaliana plants. Nucleic Acids Res 2014, 42, 2919-2931. Vrbsky J, Akimcheva S, Watson JM, Turner TL, Daxinger L, Vyskot B, Aufsatz W, Riha K. siRNA-mediated methylation of Arabidopsis telomeres. PLoS Genet 2010, e1000986.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
15. 5. 2017 15:24, prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc., učo 28574
Plný text práce
2,3 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
8. 6. 2017
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc., učo 28574
MKChr MCGPR CEITEC MU

Oponent

Autor posudku dosud neidentifikován.

Konzultanti

doc. Mgr. Miloslava Fojtová, CSc., učo 54730
MKChr MCGPR CEITEC MU
Mgr. Pavla Sováková, Ph.D.
NCBR PřF MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biochemie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.