Diplomová práce

Telomerový chromatin v mutantních rostlinách Arabidopsis thaliana s defekty v metylacích histonů

Telomeric chromatin in mutant Arabidopsis thaliana plants with defects in the histone methylations loading

Bc. Alžbeta Magdolenová
Anotace

Epigenetické modifikace DNA a histonů mají důležitou roli v regulaci genové exprese a jiných klíčových procesů v buňce. Mohou ovlivňovat i telomery, nukleoproteinové struktury chránící konce lineárních chromosomů. Tato diplomová práce se v teoretické části zabývá epigenetikou telomer, především modifikacemi histonů s nimi asociovanými. Experimentální část se věnuje studiu rostlin Arabidopsis thaliana …více

Abstract

Epigenetic modifications of DNA and histones play an important role in the regulation of gene expression and other key processes in the cell. They can also affect telomeres, the nucleoprotein structures protecting the ends of linear chromosomes. In theoretical part of this thesis, epigenetics of telomeres, especially modifications of telomeric histones are described. The experimental part is devoted …více

Zadání práce
Telomery jsou nukleoproteinové struktury lokalizované na koncích lineárních eukaryotických chromozómů, které jsou nezbytné pro zachování integrity genomu. Klasicky jsou telomery vnímány jako heterochromatinové oblasti, i když analýza telomerového chromatinu v modelové rostlině Arabidopsis thaliana (huseníček rolní) odhalila jeho duální charakter (na pomezí mezi euchromatinem a heterochromatinem) a další studie charakterizovala telomery v A. thaliana dokonce jako oblasti euchromatinové. Funkční význam modifikací telomerových histonů rostlin je doposud neznámý. Náplní diplomové práce bude analýza mutantních rostlin A. thaliana nesoucích inzerci T-DNA v genech, které kódují enzymy katalyzující metylaci nebo demetylaci histonů detekovaných v rostlinném telomerickém chromatinu. Ve následných generacích mutantních rostlin bude analyzována délka telomer, množství telomerových transkriptů TERRA a epigenetické modifikace telomerových histonů. Literatura: Fojtová M, Fajkus J. Epigenetic regulation of telomere maintenance. Cytogenet Genome Res 2014, doi:10.1159/000360775. Majerová E, Mandaková T, Wu GTH, Fajkus J, Lysák M, Fojtová M. Epigenetic features of plant telomeric chromatin at terminal versus internal positions. submitted Vrbsky J, Akimcheva S, Watson JM, Turner TL, Daxinger L, Vyskot B, Aufsatz W, Riha K. siRNA-mediated methylation of Arabidopsis telomeres. PLoS Genet 2010, e1000986. Vaquero-Sedas MI, Gamez-Arjona FM, Vega-Palas MA. Arabidopsis thaliana telomeres exhibit euchromatic features. Nucleic Acids Res 2011, 39, 2007-2017.
Práce zkontrolována:
12. 5. 2016 07:29, doc. Mgr. Miloslava Fojtová, CSc., učo 54730
Plný text práce
6,3 MB / soubor PDF
Jazyk práce
slovenština slovenština
Termín obhajoby
8. 6. 2016
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. Mgr. Miloslava Fojtová, CSc., učo 54730
NCBR PřF MU

Oponent

doc. Mgr. Miloslava Fojtová, CSc., učo 54730

Konzultant

Mgr. Pavla Sováková, Ph.D.
NCBR PřF MU

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.