Diplomová práce

Funkční ovlivnění mechanismu pro údržbu chromosomových konců v rostlinných mutantech vybraných genů kódujících proteiny se strukturními doménami potenciálně vážící DNA

Functional influence of chromosome end maintenance in distinct plant gene mutants of proteins with structural domains potentially DNA binding

Bc. Sabina Gomelská
Anotace

Nukleoproteinový komplex telomerasa se schopností prodlužovat konce lineárních eukaryotických chromosomů, je díky své roli v buněčné proliferaci a senescenci zájmem mnoha výzkumných laboratoří. Údržba chromosomových konců je vedle samotné telomerasy regulována celým komplexem proteinů asociovaných jak už s jednořetězcovou telomerovou DNA, dvouřetězcovou telomerovou DNA tak i se samotnou telomerasou …více

Abstract

Nucleoprotein complex telomerase is very interesting for many researchers specially due to its capability of lengthening linear eukaryotic chromosomal ends and its role in cellular proliferation and senescence. Chromosomal end maintenance is regulated both by telomerase and whole protein complex associated with single-stranded telomeric DNA, double-stranded telomeric DNA or with telomerase itself. …více

Klíčová slova
telomery telomerasa TERT podjednotka OB-fold proteiny Why1 protein POT1A protein protein-protein interakce telomeres telomerase TERT subunit OB-fold proteins protein-protein interactions
Zadání práce
Společným rysem mnoha proteinů, které jsou schopny se vázat na DNA nebo RNA nebo jiné proteiny, bývá přítomnost určitých strukturních domén, která je využívána pro jejich kategorizaci, vyhledání možných homologních genů, a také pro predikci jejich případné funkce. Stejné strukturní domény (např. motivy ARM, RRM, OB-fold, myb domény) však jsou přítomny v proteinech zajišťujících diametrálně rozdílné procesy, např. regulaci transkripce, struktura chromatinu, signální dráhy. Těžiště diplomové práce bude v charakterizaci vybraných mutantních linií Arabidopsis thaliana dostupných z veřejných zdrojů nesoucích T-DNA inzerci v genech pro proteiny se strukturními doménami potenciálně vážící DNA. Pro DP byly vybrány proteiny z paralelních projektů pracoviště s předpokládanou funkcí během replikace DNA a v tvorbě chromatinu a proteiny s dosud nepopsanou funkcí. Jejich možný vliv na regulaci mechanismů pro údržbu konců chromosomu bude studován prostřednictvím sledování exprese referenčních genů pomocí RT-qPCR, případně telomerového fenotypu pomocí metodik Southern hybridizace a TRAP. Doplněním bude zjištění možných protein-proteinových interakcí pomocí technik Y2H a BiFC.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
4. 1. 2018 09:10, Mgr. Eva Sýkorová, CSc., učo 26127
Plný text práce
1,4 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
14. 2. 2018
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Eva Sýkorová, CSc., učo 26127
ext NCBR PřF MU

Oponent

Mgr. Martina Dvořáčková, Ph.D., učo 51932
MKChr MCGPR CEITEC MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biochemie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.