Řešení některých důležitých evolučních i ekologických otázek se neobejde bez analýzy diverzity mezi- i vnitrodruhových molekulárních znaků. Porovnáním diverzity genetických linií uvnitř druhu lze například dovodit pravděpodobný scénář osidlování území v temperátní zóně po posledním glaciálu. Recentně publikované studie například ze srovnání genetické diverzity u korýše Gammarus fossarum agg. v oblasti Českého masivu a Západních Karpat usuzují na pravděpodobnou existenci glaciálních refugií v Západních Karpatech. Bylo by zajímavé ověřit tyto hypotézy na dalších skupinách permanentní fauny. Pro sladkovodní plazivky (Copepoda: Harpacticoida), mikroskopické bentické korýše, kteří tvoří často velmi početnou složku společenstev chladných tekoucích vod, však nejsou dosud k dispozici témeř žádná molekulárně-genetická data. Tato bakalářská práce by měla sloužit především ke stanovení vhodného metodického postupu molekulárně-genetických analýz plazivek, ale zároveň tím poskytne i nové údaje o DNA sekvencích některých druhů. Cílem práce je 1) vypracovat literární rešerši, zahrnující a) stručný přehled o principech a použití molekulárních analýz DNA se zaměřením na skupinu korýšů, b) stav výzkumu založeného na genetických markerech u plazivek (Copepoda: Harpacticoida), zvláště neparazitických sladkovodních zástupců; c) stav poznání diverzity plazivek v České republice a na Slovensku na základě morfologie; 2) vypracovat protokol molekulární analýzy DNA plazivek vhodný pro COI, případně i pro další vybraný, jaderný gen; 3) analyzovat plazivky ze vzorků pramenišť v Čechách (extrakce, PCR, elektroforéza, příprava na sekvenaci, alignment) a provést druhové určení na základě morfologie exuvií; 4) porovnat získané sekvence s databází GenBank a nepublikovanými výsledky analýz plazivek z pramenišť Západních Karpat.