Bakalářská práce

Molekulární analýza DNA plazivek (Copepoda: Harpacticoida) z území Česka a Slovenska se zaměřením na rod Bryocamptus

Molecular DNA analysis of harpacticoids (Copepoda: Harpacticoida) from Czechia and Slovakia with emphasis on the genus Bryocamptus

Silvie Borková
Anotace

Tato bakalářská práce se zabývá genetickou diverzitou plazivek (Harpacticoida), zvláště rodu Bryocamptus z území Česka a Slovenska. Molekulárním zpracováním vybraných, morfologicky do druhu určených jedinců z 25 lokalit Hercynika a Západních Karpat byly získány sekvence mitochondriálního markeru COI a jaderného markeru 28S. Druhová delimitace na základě genetických vzdáleností a fylogenetické stromy …více

Abstract

This bachelor thesis deals with the genetic diversity of harpacticoids (Harpacticoida), with an emphasis on the genus Bryocamptus from Czechia and Slovakia. Molecular processing of selected individuals, morphologically identified to species, and coming from 25 sites of the Hercynian and Western Carpathian regions, yielded sequences of the mitochondrial marker COI and nuclear marker 28S. Species delimitation …více

Zadání práce
Sladkovodní plazivky (Copepoda: Harpacticoida: Canthocamptidae) jsou z molekulárního hlediska dosud velmi málo prozkoumány a v databázích zatím chybí údaje k převážné většině druhů. Předchozí studentská práce poskytla prvotní vhled do vztahů mezi několika běžnými druhy a jejich vnitrodruhové variability; naznačila například kryptickou diverzitu u jednoho z našich nejběžnějších druhů Bryocamptus spinulosus, s možnou geografickou závislostí. Avšak tyto výsledky nebyly dostatečně robustní a nepodařilo se je propojit s morfologickou analýzou. Tato bakalářská práce by měla pokračovat v započatém výzkumu rozšířením datasetu a pokusit se tuto kryptickou diverzitu blíže prozkoumat a dále vyhodnotit, zda vymezení podrodů rodu Bryocamptus na základě morfologie koresponduje s fylogenetickou příbuzností.
Cíle práce jsou:
1) vypracovat literární rešerši, která popíše a) druhovou diverzitu čeledi Canthocamptidae a zvláště rodu Bryocamptus a jeho podrodů, a b) shrne dosavadní znalosti o sladkovodních plazivkách na základě dostupných molekulárních dat;
2) získat vlastní sekvence COI a 28S pro vybrané druhy plazivek z lokalit v Čechách a na Slovensku;
3) provést morfologické určení na základě morfologie exuvií a vyhotovit dokladový materiál ve formě trvalých preparátů;
4) provést revizi vybraných sekvencí z dřívějších prací podle chromatogramů a doplnit tak vlastní dataset;
5) vyhodnotit vztahy mezi jednotlivými druhy a míru druhové kryptické diverzity, a zaměřit se přitom na rod Bryocamptus a jeho podrody.
Práce zkontrolována:
13. 5. 2026 21:01, Mgr. Marie Zhai, Ph.D., učo 11978
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
22. 6. 2026
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Marie Zhai, Ph.D., učo 11978
Hydro ÚBZ Biol PřF MU

Oponent

Mgr. Veronika Horsáková, Ph.D., učo 268751
EkoRas ÚBZ Biol PřF MU

Konzultant

Mgr. Mária Seifertová, Ph.D., učo 108415
ÚBZ Biol PřF MU

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.