Bakalářská práce

Korelace klinických proměnných se složením střevního mikrobiomu u pacientů s kolorektálním karcinomem

Correlation of clinical variables and composition of gut microbiota of colorectal cancer patients

Jakub Jamárik, učo 461084
Anotace

Kolorektální karcinom je maligní nádorové onemocnění, které se vyznačuje vysokou heterogenitou. Za posledních 10 let bylo vynaloženo značné úsilí na vytvoření molekulárních podtypů tohoto onemocnění, ale to nebylo úspěšné. V současné dobé jsou dostupné metody, které umožňují zachytit mikroprostředí nádoru, jehož součástí je mimo jiné i střevní mikrobiom. Pojem střevní mikrobióm označuje soubor všech …více

Abstract

Colorectal carcinoma is an oncological disease with a high degree of heterogeneity. A considerable amount of research into molecular subtypes of the disease has been done in the past 10 years but it still remains unsuccessful. Current methods allow for assessment of the tumor microenvironment variant such as microbiome. The term itself refers to the genome of the gut microorganisms. Research supports …více

Klíčová slova
Kolorektální karcinóm Mikrobióm Klinické proměnné Kompoziční data Colorectal cancer Microbiome Clinical variables Compositional data
Zadání práce
Cílem práce je korelace dat střevního mikrobiomu pacientů s nádorem tlustého střeva s dostupnými klinickými proměnnými. Student/ka dostane k dispozici tabulku složení mikrobiomu stolice ze 16S rRNA sekvenování s klinickými informacemi o pacientech (např. stádium onemocnění, umístění nádoru, atd.) léčených na Masarykově onkologickém ústavu.

Student/ka v této práci:
  1. Nastuduje dosud známe poznatky o vlivu mikrobiomu na vývoj kolorektálního karcinomu
  2. Vytvoří základní popisné statistiky a grafy složení mikrobiomu u jednotlivých pacientů
  3. Asociuje mikrobiální složení na všech dostupných taxonomických úrovních s klinickými proměnnými

Doporučená literatura
  • DZUSTEV, A., GOLDSZMID, R. S., VIAUD, S. et al., 2015: The role of the microbiota in inflammation, carcinogenesis, and cancer therapy. European Journal of Immunology 45(1):17-31.
  • KANG M., MARTIN, A., 2017: Microbiome and colorectal cancer: Unraveling host-microbiota interactions in colitis-associated colorectal cancer development. Seminars in Immunology 32:3-13.
  • MIMA, K., NISHIHARA, R., QIAN, Z. R., et al., 2017. Fusobacterium nucleatum in colorectal carcinoma tissue and patient prognosis. Gut 65(12):1973-1980.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
13. 5. 2019 12:43, Mgr. Barbora Zwinsová, Ph.D., učo 356955
Plný text práce
3,1 MB / soubor PDF
Jazyk práce
slovenština slovenština
Termín obhajoby
21. 6. 2019
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Barbora Zwinsová, Ph.D., učo 356955
MicroBiom CentLab RECETOX PřF MU

Oponent

Mgr. Ing. Karel Sedlář, Ph.D.
Vysoké učení technické v Brně, Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Experimentální biologie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.