Diplomová práce

PredictSNP onco: server pro automatickou analýzu mutací přispívajících k rozvoji rakoviny

PredictSNP onco: web server for automatic analysis of oncology-based mutations

Bc. Adam Dobiáš
Anotace

Rakovina popisuje rozsáhlou skupinu onemocnění způsobených poškozením DNA a narušením buněčné regulace. Je jednou z hlavních příčin smrti ve světe. Tradičná léčba je často neefektivní a způsobuje mnoho nepříznivých vedlejších účinků. Je tedy potřeba personalizované onkologie, která léčí chorobu analýzou mutací konkrétního pacienta a přizpůsobuje léčbu výhradně jeho potřebám. Multidisciplinární komise …více

Abstract

Cancer describes a broad range of diseases that are caused by DNA damage and disrupted cell regulation and is one of the leading causes of death globally. Traditional treatment is often ineffective and causing a lot of adverse effects. Therefore, there is need for personalized oncology which tackles the disease by analyzing the mutations of a particular patient and tailoring the treatment to his exclusive …více

Zadání práce
Personalizovaná onkologie je individuální medicína, která poskytuje správnou péči správnému pacientovi ve správný čas a vede k měřitelným výsledků a racionálnímu vynaložení nákladů na zdravotní péči. V současnosti je standardním přístupem pro vypracování léčebných plánů použití multidisciplinárních panelů, které přezkoumají dostupné výsledky a pro specifikují typ terapie. Diskuse na těchto panelech jsou často brzdí nedostatek času k analýze množství genomických, proteomických a klinických studií a lékaři mají tendenci se uchylovat k tradičním zavedeným strategiím. V této práci se budeme zabývat in silico platformou, která bude analyzovat mutace v proteinech, které se podílejí na rakovinném růstu, identifikované sekvenováním transkriptomu. Platforma se pokusí předpovědět vliv mutací a navrhne nejslibnější látky na léčbu onemocnění. Cílem této práce bude navrhnout a implementovat tuto platformu jako webový server s důrazem na časovou efektivitu, robustnost a uživatelskou přívětivost. Server pak bude sloužit lékařům jako hlavní zdroj dat pro následné rozhodování o strategii léčby.
Práce zkontrolována:
3. 2. 2021 16:59, doc. Mgr. David Bednář, Ph.D., učo 222755
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
15. 2. 2021
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. Mgr. David Bednář, Ph.D., učo 222755
Model ProtIng RECETOX PřF MU

Oponent

doc. RNDr. Barbora Kozlíková, Ph.D., učo 60850
KVI FI MU

Konzultanti

prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr., učo 1441
Model ProtIng RECETOX PřF MU
Mgr. Jan Dvorský, Ph.D.
LosLab ÚEB Biol PřF MU

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.