Bakalářská práce

Exprese varianty přijímačové domény histidinkinasy CKI1 rostliny Arabidopsis thaliana napodobující přijímačovou doménu AHK5.

Expression of a variant of receiver domain of CKI1 histidine kinase from Arabidopsis thaliana mimicking the AHK5 receiver domain

Petra Kavalcová
Anotace

V rostlině Arabidopsis thaliana, je dvoukomponentní systém používán k detekci signálu. Je také zodpovědný za přenos fosfátu mezi histidinkinázou a proteinem přenášející fosfát (AHP). Histidinkinázy se skládají ze tří domén: extracelulární a intracelulární histidinkinázové a přijímačové domény. Po navázání extracelulárního signálu na extracelulární doménu je histidinkinázová doména fosforylována; fosfát …více

Abstract

In Arabidopsis thaliana, the two-component system is used to detect environmental signals. It is responsible for transport of phosphate between histidine kinase and Arabidopsis histidine phospho-transfer protein (AHP). Histidine kinases include three domains: extracellular, and intracellular histidine-kinase and receiver domains. Upon binding of ligand to the extra-cellular domain, histidine kinase …více

Zadání práce
The loop L5 of the receiver domain of the histidine kinase CKI1 (CKI1-RD) is thought to be responsible for the interaction with AHP2. By changing the loop L5 of CKI1-RD by the loop L5 of AHK5-RD, the protein CKI1RD-L5-AHK5 would mimic the receiver domain of AHK5, and loose its specificty for AHP2 while being specific for AHP1. The student will be responsible of cloning the loop of AHK5 into CKI1-RD, expressing CKI1-RD-L5-AHK5 in E. coli and establish the purifications conditions. Finally interaction between CKI1RD-L5-AHK5 and AHP2 and AHP1 will be measured by ELISA.
Práce zkontrolována:
16. 5. 2014 09:19, Séverine Jansen, PhD., učo 128288
Plný text práce
1,4 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
9. 6. 2014
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Séverine Jansen, PhD., učo 128288
BNMRS CSB CEITEC MU

Oponent

Autor posudku dosud neidentifikován.

Literatura

  • PEKÁROVÁ, Blanka; Tomáš KLUMPLER; Olga TŘÍSKOVÁ; Jakub HORÁK; Séverine JANSEN; Radka DOPITOVÁ; Petra BORKOVCOVÁ; Veronika PAPOUŠKOVÁ; Eliška NEJEDLÁ; Vladimír SKLENÁŘ; Jaromír MAREK; Lukáš ŽÍDEK; Jan HEJÁTKO a Lubomír JANDA. Structure and binding specificity of the receiver domain of sensor histidine kinase CKI1 from Arabidopsis thaliana. The Plant Journal. England: BLACKWELL PUBLISHING, 2011, roč. 67, č. 5, s. 827-839. ISSN 0960-7412. Dostupné z: https://doi.org/10.1111/j.1365-313X.2011.04637.x.

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.