Diplomová práce

Příprava komplexních proteinových vzorků před LC-MS/MS analýzou

Preparation of complex protein samples for LC-MS/MS analysis

Bc. Markéta Mecerodová
Anotace

Příprava proteinového vzorku je klíčovým krokem celého proteomického experimentu. Kvůli různorodosti proteomu musí být metody přizpůsobeny rozmanitým koncentračním rozpětím proteinů nebo různým fyzikálněchemickým vlastnostem jednotlivých proteinů. Prezentovaná diplomová práce se zabývá optimalizací enzymatického štěpení komplexní proteinové směsi Arabidopsis thaliana před LC-MS/MS analýzou. Proteinová …více

Abstract

The preparation of the protein sample is a key step in the proteomic experiment. Due to diversity of the proteom, the methods must be adjusted to various concentration ranges or different physico-chemical properties of individual proteins. The presented thesis deals with optimization of enzymatic digestion of complex protein mixture of Arabidopis thaliana before LC-MS/MS analysis. The protein mixture …více

Klíčová slova
proteomika protein peptid Arabidopsis thaliana FASP příprava vzorku proteomics peptide sample preparation
Zadání práce
Příprava vzorku v proteomické analýze je klíčovým krokem rozhodujícím o úspěšnosti celého postupu. Komplexní vzorky, jako např. buněčné lyzáty obsahují až 10 000 proteinů či jejich forem a jednotlivé proteiny jsou zastoupeny v několika řádovém rozsahu koncentrací. Takto příprava vzorku, resp. zachování proteinového složení během přípravy, představuje poměrně složitý úkol. Volba postupu zpracování vzorku zásadním způsobem určuje kvalitu informace získané následnou hmotnostně spektrometrickou analýzou. Předmětem diplomové práce bude optimalizace jednotlivých kroků zpracování komplexních proteinových vzorků (se zaměřením na metodu FASP – „Filter Aided Sample Preparation“, a její varianty) s cílem získání maximální kvalitativní i kvantitativní informace o proteinovém složení vzorku. Práce bude vypracována na pracovišti VS Proteomika, CEITEC-MU (pavilon A26) s využitím moderní hmotnostně spektrometrické instrumentace.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
16. 5. 2017 07:23, prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr., učo 34759
Plný text práce
2,2 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
5. 6. 2017
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr., učo 34759
ÚEB Biol PřF MU

Oponent

Autor posudku dosud neidentifikován.

Konzultant

Mgr. Karel Stejskal, Ph.D.
abs PřF MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biochemie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.