Diplomová práce

Vývoj metod přípravy vzorku proteinů před hmotnostně spektrometrickou analýzou

Development of protein sample preparation methods for mass spectrometric anaylsis

Bc. Nela Pastyříková
Anotace

Tato diplomová práce se zabývá vývojem metod přípravy vzorku proteinů před hmotnostně spektrometrickou analýzou. Cílem práce bylo zařadit alternativní metodu pro štěpení disulfidických vazeb – oxidaci kyselinou peroxymravenčí pomocí mikrovln – do protokolů přípravy vzorku FASP (Filter-aided sample preparation) a SP3 (Single-pot solid-phase-enhanced sample preparation). Postupy byly optimalizovány na …více

Abstract

This thesis focuses on the development of protein sample preparation methods prior to mass spectrometric analysis. The aim of the work was to incorporate an alternative method for disulfide bond cleavage – performic acid oxidation assisted by microwave irradiation – into the FASP (Filter-Aided Sample Preparation) and SP3 (Single-Pot Solid-Phase-Enhanced Sample Preparation) protocols. The procedures …více

Klíčová slova
Proteomika příprava vzorku oxidace kyselinou peroxymravenčí FASP SP3 hmotnostní spektrometrie proteomics sample preparation performic acid oxidation mass spectrometry
Zadání práce
Náplní práce bude adaptace dvou postupů přípravy vzorku FASP (Filter-Aided Sample Preparation) a SP3 (Single-pot Solid-phase-enhanced Sample Preparation) pro spojení s alternativní metodou pro odstranění disulfidických můstků spočívající v jejich oxidaci působením kyseliny peroxymravenčí za účasti mikrovln. Metody budou optimalizovány na modelovém proteinu (hovězí sérový albumin), přičemž získané proteolytické směsi budou analyzovány pomocí kapalinové chromatografie spojené s tandemovou hmotnostní spektrometrií. Cílem pak bude posouzení vhodnosti postupu na reálném vzorku proteinového extraktu z rostlin, případně z dalších vzorků, ve srovnání s rutinním postupem zahrnujícím redukci disulfidických můstků s následnou alkylaci volných thiolových skupin. Seznam doporučené odborné literatury: Hughes et al.: Single-pot, solid-phase-enhanced sample preparation for proteomics experiments. Nature Protocols 14 (2019) 68-85. Wisniewski et al.: Universal sample preparation method for proteome analysis. Nature Methods 6 (2009) 359-362.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
16. 5. 2025 09:39, Mgr. Ondrej Šedo, Ph.D., učo 13589
Plný text práce
1,5 MB / soubor PDF
Přílohy (1)
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
10. 6. 2025
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Ondrej Šedo, Ph.D., učo 13589
Prot MCGPR CEITEC MU

Oponent

Ing. Václav Pustka, učo 451768
Prot MCGPR CEITEC MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Genomika a Proteomika

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.