Diplomová práce

Celogenomová sekvenace Treponema pallidum subsp. pallidum kmene Grady

Whole genome sequencing of Treponema pallidum subsp. pallidum strain Grady

Bc. Anežka Niesnerová
Anotace

V této práci byla sestavena a analyzována celogenomová sekvence bakterie Treponema pallidum subsp. pallidum kmene Grady. Tato bakterie je patogenem specializovaným na jediného hostitele, kterým je člověk, a vyvolává u něj onemocnění syfilis. Vzhledem k obtížné kultivaci této bakterie in vitro, která dlouhou dobu nebyla možná, používají se k získání informací o tomto druhu metody molekulární biologie …více

Abstract

In this thesis, a whole genome sequence of bacterium Treponema pallidum subsp. pallidum strain Grady was assembled and analyzed. This bacterium is a pathogen specialized on a single host, a human, and causes disease syphilis. Due to difficult cultivation of this bacterium in vitro, which was not possible for a long time, methods of molecular biology are used to gain information about this species. …více

Klíčová slova
Treponema Treponema pallidum Grady sekvenace komparativní genomika fylogenetická analýza
Zadání práce
Treponema pallidum subsp. pallidum je původcem venerického onemocnění syfilis a kmen Grady byl izolován po roce 1980 v Atlantě, USA. V Atlantě byl izolován i referenční kmen SS14 (v roce 1977), jehož celogenomová sekvence je známa. Celogenomová sekvence kmene Grady slibuje přinést nové poznatky pro fylogenezi syfilis, zejména pak s ohledem na celosvětovou predominanci kmenů podobných referenčnímu kmeni SS14. Cílem diplomové práce je sestavení kompletní genomové sekvence pomocí metody PSGS, která umožňuje sestavení nepřerušované kompletní genomové sekvence a detailní popis a analýzu tohoto genomu ve světle poznatků získaných z jiných treponemálních genomů.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
13. 5. 2019 08:36, prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D., učo 1116
Plný text práce
2,1 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
25. 6. 2019
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D., učo 1116
ÚEB Biol PřF MU

Oponent

Mgr. Bc. Darina Čejková, Ph.D., učo 15880
ext NCBR PřF MU

Konzultant

Mgr. Lenka Paštěková, Ph.D., učo 72338
ÚEB Biol PřF MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biologie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.