Diplomová práce

Exprese, purifikace a reasociace specifických podjednotek a sigma faktorů RNA polymerázy z bakterie Bacillus subtilis za účelem strukturní charakterizace

Expression, purification, and reassociation of specific subunits and sigma factors of RNA polymerase from Bacillus subtilis for structural characterization

Bc. Anna Kozáková
Anotace

RNA polymeráza (RNAP) je klíčový enzym zodpovědný za transkripci genů v prokaryotických buňkách. Většina funkčních a strukturních studií se historicky sou-středila na modelový organismus Escherichia coli (E. coli), ale pozornost se v poslední době obrací také k Gram-pozitivním bakteriím jako je Bacillus subtilis (B. subtilis). RNAP B. subtilis se liší specifickými podjednotkami, které zahrnují i akcesorní …více

Abstract

RNA polymerase (RNAP) is the key enzyme responsible for the transcription of genes in prokaryotic cells. While most structural and functional studies have historically focused on Escherichia coli (E. coli), attention has been moving toward Gram-positive model organisms, like Bacillus subtilis (B. subtilis). The B. subtilis RNAP has a specific subunit composition, including accessory subunits – δ and …více

Klíčová slova
RNA polymeráza Bacillus subtilis Bakteriální transkripce Iniciace transkripce Exprese proteinů Purifikace proteinů Rekombinantní proteiny Sigma faktory Bacterial transcription Expression of proteins Protein purification Recombinant proteins Sigma factors 2D klasifikace
Zadání práce

RNA polymeráza je klíčovým enzymem odpovědným za přepis genetické informace. U gram-pozitivních bakterií, jako je modelový organismus Bacillus subtilis, má RNA polymeráza komplexní strukturu, která zahrnuje základní podjednotky a další regulační komponenty, jako jsou sigma faktory nebo další podjednotky. Tyto podjednotky a faktory hrají významnou roli v regulaci transkripce, zajišťují specifickou vazbu na promotory a ovlivňují účinnost transkripčního procesu.

Detailní poznání interakce jednotlivých podjednotek a sigma faktorů u B. subtilis je nezbytné pro pochopení mechanismů transkripce a její regulace. Strukturní studium RNA polymerázy a jejích podjednotek se neobejde bez kvalitních a homogenních vzorků proteinů.

Cílem diplomové práce je zaměření se na expresi jednotlivých podjednotek a sigma faktorů RNA polymerázy z B. subtilis v rekombinantním systému, jejich purifikaci a následnou reasociaci do funkčních komplexů. Důraz bude kladen na optimalizaci protokolů pro purifikaci proteinů s vysokou čistotou a stabilitou, aby mohly být využity pro reasociaci a následnou strukturní charakterizaci metodami, jako je kryoelektronová mikroskopie (cryo-EM) nebo nukleární magnetická rezonance (NMR).

Administrativní informace
Práce zkontrolována:
15. 5. 2026 06:23, prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990
Plný text práce
2,4 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
9. 6. 2026
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990
BNMRS CSB CEITEC MU

Oponent

Mgr. Radka Dopitová, Ph.D., učo 12868
CF BIC CSB CEITEC MU

Konzultant

Mgr. Martin Černý, Ph.D., učo 451182
abs PřF MU

Literatura

  • VOET, Donald; Judith G. VOET a Charlotte W. PRATT. Voet's principles of biochemistry. Global edition. Singapore: John Wiley & Sons, 2016, xvi, 1098. ISBN 9781119451662.
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Biomolekulární chemie

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.