Bakalářská práce

Vztah struktury nukleových kyselin a NMR chemických posunů jader C-13

Relationship between nucleic acid structure and NMR chemical shifts of C-13 nuclei

Martin Kryl
Anotace

V současné době je snaha rozšířit metody získání NMR restrainů pro výpočet trojrozměrných struktur nukleových kyselin o restrainy jiné než je Overhauserův jev a spin spinová skalární interakce. Jedním z nabízejících se zdrojů informací o uspořádání molekuly je chemický posun, jehož výhodou je snadná měřitelnost a existující metodika v případě proteinů. Cílem této práce je zpracovat záznamy v současné …více

Abstract

Currently, there is an effort to expand methods of obtaining NMR restrains for calculations of 3D structures of nucleic acids other than Overhauser effect a J-coupling. One possible source of information about 3D structures of nucleic acids are the chemical shifts of 13C atoms. Their advantage is that they are easy to measure and the methodology for their use already exists for proteins. The goal of …více

Klíčová slova
13C chemický posun RNA DNA struktura NMR
Zadání práce
Cílem práce je zjistit, zda lze chemické posuny jader C-13 v nukleových kyselinách použít k předpovědi jejich struktury. K tomu je třeba shromáždit co největší množství známých údajů o chemických posunech v nukleových kyselinách a o struktuře odpovídajících molekul, zhodnotit spolehlivost těchto dat, a ve výsledné databázi hledat příslušné souvislosti. V databázích BMRB a PDB vyhledejte údaje o chemických posunech C-13 a strukturách nukleových kyselin. Pro vybrané oligonukleotidy, jejichž struktura je spolehlivě známa, simulujte chemické posuny C-13 pomocí programu MolMol. Vypočtené hodnoty porovnejte s experimentálními daty a pokuste se identifikovat strukturně závislé příspěvky k chemickému posunu.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
17. 5. 2011 11:07, doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc., učo 564
Plný text práce
626,6 KB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
13. 6. 2011
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc., učo 564
NCBR PřF MU

Oponent

Autor posudku dosud neidentifikován.
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biochemie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce
 
Název
Vložil
Vloženo
Práva
Archiv závěrečné práce Martin Kryl PřF B-BCH BCHM jhg3o/6
Kryl, M.
13. 5. 2011
Složky
Soubory
Anotace anglicky annotation_english.txt
Kryl, M.
13. 5. 2011
Anotace česky annotation.txt
Kryl, M.
13. 5. 2011
Klíčová slova keywords.txt
Kryl, M.
13. 5. 2011
Plný text práce kryl_bak.pdf
Kryl, M.
13. 5. 2011
Posudek oponenta Posudek_oponenta.pdf
Fiala, R.
6. 6. 2011

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.