Diplomová práce

Porovnání informačního obsahu v různých typech tomografických dat v kryo-elektronové mikroskopii

Comparative Analysis of Data Collection Strategies in Cryo-Electron Tomography

Bc. Anna Kasáková
Anotace

Tato práce se zaměřuje na systematické porovnání různých strategií získávání dat kryoelektronové tomografii a jejich vlivu na kvalitu trojrozměrných rekonstrukcí. Jako modelový systém byl použit bakteriofág. Experimentálně bylo testováno několik schémat sběru dat při různých náklonech a úhlových rozmezích, a to jak se zvýšením kontrastu pomocí Voltovy fázové destičky, tak bez ní. Byl zkoumán vliv těchto …více

Abstract

This thesis focuses on a systematic comparison of various cryo-electron tomography data acquisition strategies and their effect on the three-dimensional reconstructions quality. Bacteriophage was used as a model system. Several data acquisition schemes were experimentally tested at different tilt increments and angular ranges, both with and without contrast enhancement by the Volta phase plate. The …více

Klíčová slova
Kryo-elektronová Mikroskopie Kryo-elektronová Tomografie Bakteriofág Volta fázová destička Náklonové schéma FSC křivka Rozlišení Poměr signálu k šumu Cryo-electron Microscopy Cryo-electron Tomography Bacteriophage Volta phase plate Tilt scheme FSC curve Resolution Signal-to-noise ratio
Zadání práce
Zadání:
  1. Provedení literární rešerše metod a strategií měření tomografických dat pomocí (skenovací) transmisní elektronové mikroskopie.
  2. Výběr vhodných vzorků pro porovnávání informačního obsahu v tomografických datech
  3. Měření tomografických dat pomocí elektronové mikroskopie za kryogenních podmínek.
  4. Navržení metody kvantitativního porovnání informačního obsahu v měřených datech.
  5. Analýza dat a diskuze výsledků.

Literatura:
  • Stokes D.J. (2008) Principles and practice of variable pressure/environmental scanning electron microscopy. Wiley & Sons Ltd. ISBN: 978-0-470-06540-2
  • Reimer L. (2012) Scanning electron microscopy. Springer, ISBN: 978-3-642-08372-3
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
11. 5. 2025 08:01, Mgr. Jiří Nováček, Ph.D., učo 151132
Plný text práce
36,3 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
26. 6. 2025
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Jiří Nováček, Ph.D., učo 151132
CryoEM CSB CEITEC MU

Oponent

Ing. Tibor Füzik, Ph.D., učo 236682
StrvIR CSB CEITEC MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Biofyzika

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.