Národní registr hospitalizovaných (NRHOSP) je populačním zdrojem dat o osobách hospitalizovaných na lůžkových odděleních včetně příslušných hospitalizačních diagnóz kódovaných podle MKN-10 klasifikace. Tato data lze využít ke zkoumání progrese onemocnění a hodnocení asociací mezi nemocemi. Sít humánních fenotypů (phenotypic disease network – PDN) vyjadřuje spojitost mezi výskytem jednotlivých onemocnění, avšak nehodnotí časovou souslednost výskytu. Úkolem studentky bude vytvořit síť nemocí rozšířenou o kauzální informaci, identifikovat zajímavé vztahy a objasnit jejich mechanismy, jsou-li známy.

Cíle práce:
1) rešerše dostupné literatury zabývající se využitím administrativních dat nemocnic pro hodnocení kauzálních vztahů mezi výskytem nemocí;
2) seznámení se se strukturou dat NRHOSP, provedení vhodné transformace dat a výběr optimální metodiky pro jejich analýzu;
3) nalezení netriviálních orientovaných vztahů mezi výskytem nemocí na základě historie hospitalizací pacientů se záznamem v datech NRHOSP;
4) vizualizace a zhodnocení nalezených a potenciálně zajímavých vztahů;
5) srovnání výsledků práce se závěry jiných publikovaných studií.

Doporučená literatura:
Hidalgo, C. A., Blumm, N., Barabási, A. L., & Christakis, N. A. (2009). A dynamic network approach for the study of human phenotypes. PLoS Comput Biol, 5(4).
Kannan, V., Swartz, F., Kiani, N. A., Silberberg, G., Tsipras, G., Gomez-Cabrero, D., Alexanderson, K., Tegnèr, J. (2016). Conditional disease development extracted from longitudinal health care cohort data using layered network construction. Scientific reports, 6.