Bakalářská práce

Extrakce geometrických parametrů buněk ve 2-D obrazech z optické mikroskopie

Extraction of cells' geometrical parametres in 2-D images from optical microspcopy

Pavlína Krečmerová
Anotace

Tato práce se zabývá metodami segmentace 2-D obrazů a jejich možným využitím při automatické analýze digitálních obrazů v rámci hematologické diagnostiky. Vedle teoretického rozboru dané problematiky je zde navržen algoritmus, který realizuje počítání buněk a měření jejich základních geometrických parametrů, jako je obvod, excentrita aj. v barevných digitálních 2-D obrazech hematologických preparátů …více

Abstract

This work deals with 2-D image segmentation methods and their possible use in automatic analysis of digital images within haematological diagnostics. In addition to the theoretical analysis of the issue there is a proposed algoritm, which realizes counting cells and measuring their fundamental geometric parameters, such as perimeter, eccentricity and others in 2-D colour digital images of haematological …více

Klíčová slova
Zpracování a analýza obrazů digitální mikroskopie segmentace prahování binární obraz erytrocyty trombocyty sférocytóza entropie.
Zadání práce
Cílem práce je seznámit se s metodami segmentace 2-D obrazů buněk z mikroskopických preparátů a pomocí vybraných postupů navrhnout algoritmus pro automatickou extrakci geometrických parametrů buněk v barevných obrazech hematologických preparátů v optické mikroskopii. Konkrétně bude studentka řešit následující úkoly:
  1. Rešerše literatury relevantní k problematice automatické segmentace
  2. Prověření funkcionality existujících softwarových balíků pro zpracování a analýzu digitálních mikroskopických obrazů
  3. Návrh a implementace algoritmu pro automatický popis obrazu hematologického preparátu za účelem diagnostiky onemocnění sferocytózou. Tento hlavní úkol zahnuje mj.
    • převody formátu obrazů z barevného schématu RGB na šedotónový obraz včetně metodiky pro výběr nebo kombinace barevných kanálů,
    • předzpracování obrazů ve smyslu úpravy jasu a kontrastu za účelem zlepšení jejich vlastností pro účely následné automatické segmentace,
    • předzpracování obrazů ve smyslu morfologických operací zabraňujících stékání objektů po prahování,
    • volba prahu pro binární dělení šedotónových obrazů na objekty a pozadí,
    • měření ploch buněk v segmentovaných obrazech a výpočet veličin důležitých pro diagnostiku sferocytózy.
Praktické části bakalářské práce budou řešeny ve vývojovém prostředí Matlab.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
27. 5. 2009 23:18, prof. Ing. Daniel Schwarz, Ph.D., učo 195581
Plný text práce
5,9 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
17. 6. 2009
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. Ing. Daniel Schwarz, Ph.D., učo 195581
IBA SpolP LF MU

Oponent

RNDr. Jiří Jarkovský, Ph.D., učo 9787
IBA SpolP LF MU

Literatura

  • Číslicová filtrace, analýza a restaurace signálů. Edited by Jiří Jan. 2. uprav. a rozš. vyd. Brno: VUTIUM, 2002, 427 s. ISBN 8021415584.
  • JAN, Jiří. Medical image processing, reconstruction and restoration : concepts and methods. Boca Raton: Taylor & Francis, 2006, xxiii, 730. ISBN 0824758498.
  • SVOBODA, Tomáš; Jan KYBIC a Václav HLAVÁČ. Image processing, analysis, and machine vision : a Matlab companion. Toronto: Thomson, 2008, xi, 255. ISBN 9780495295952.
  • SCHLESINGER, Michail I. a Václav HLAVÁČ. Ten lectures on statistical and structural pattern recognition. Dordrecht: Kluwer academic publishers, 2002, xix, 519. ISBN 140200642X.
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biologie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce
 
Název
Vložil
Vloženo
Práva
Archiv závěrečné práce Pavlína Krečmerová PřF B-BI BIMAT lj4rz/6
Krečmerová, P.
29. 4. 2009
Složky
Soubory
Anotace anglicky annotation_english.txt
Krečmerová, P.
14. 5. 2009
Anotace česky annotation.txt
Krečmerová, P.
6. 5. 2009
bc.pdf
Krečmerová, P.
24. 5. 2009
BP-oponent-dr.Jarkovsky_-_Krecmerova.doc
Jarkovský, J.
16. 6. 2009
Klíčová slova keywords.txt
Krečmerová, P.
29. 4. 2009

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.