Microarray technologie představují důležitý nástroj při studiu mnoha nejrůznějších oblastí biologie, a to zejména díky možnosti detekovat a analyzovat tisíce různých genů v jednom experimentu. Microarraye jsou proto široce využívány například při diagnostice, komparativní genomice, mutačních analýzách, evolučních studiích, expresních studiích, apod. Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis je původcem chronického infekčního onemocnění přežvýkavců (paratuberkulóza, Johneho choroba), které se projevuje chronickým hubnutím, sníženou dojivostí, průjmy a celkovou ztrátou kondice zvířete. Výskyt tohoto onemocnění u skotu (ale i jiných hospodářských a divokých zvířat) se rok od roku zvyšuje, což má za následek významný ekonomický dopad na chovatele dobytka a mléčný průmysl. V této bakalářské práci budou shrnuty doposud získané poznatky studia komparativní genomiky pomocí microarray technologie na izolátech Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (MAP). Práce by měla být rozdělena do tří celků. První celek se bude zabývat charakteristikou Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis, jeho taxonomií, vlastnostmi a patogenitou pro zvířata, případně pro člověka. Druhá část velmi stručně přiblíží metody studia komparativní genomiky; silný důraz bude kladen na metodiku mikročipů (jejich princip, typy, použití, vyhodnocení). Ve třetí části budou shrnuty a porovnány studie, které se doposud zabývaly studiem genomů u různých izolátů MAP (cattle a sheep izoláty) nebo které porovnávaly odlišnosti genomu MAP oproti genomu blízce příbuzného Mycobacterium avium subsp. avium.