Disertační práce

Výzkum Nekanonických Nukleových Kyselin Pomocí Simulací Molekulární Dynamiky

Investigations of Noncanonical Nucleic Acids Using Molecular Dynamics Simulations

Zhengyue Zhang, MSc.
Anotace

Nekanonické struktury nukleových kyselin hrají klíčové role v řadě biologických procesů. Simulace molekulární dynamiky (MD) prokázaly pozoruhodné schopnosti při objasňování biomolekulární dynamiky s vysokým prostorovým a časovým rozlišením. Přesnost MD při reprodukci struktur a dynamiky nukleových kyselin, zejména nekanonických DNA a RNA struktur, však naráží na několik překážek. Tato práce poskytuje …více

Abstract

Noncanonical nucleic acid structures, which play crucial roles in a variety of biological processes, deserve in-depth investigations. Molecular Dynamics (MD) simulations have shown remarkable capabilities for elucidating biomolecular dynamics at high spatial and temporal resolutions. However, the accuracy of MD in reproducing the structures and dynamics of nucleic acids, particularly noncanonical DNA …více

Klíčová slova
Nekanonické struktury nukleových kyselin riboswitch-sensing neomycin Holliday Junction G-kvadruplex simulace molekulární dynamiky enhanced sampling Noncanonical nucleic acid structures neomycin-sensing riboswitch G-quadruplex Molecular Dynamics simulations enhanced sampling methods
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
13. 2. 2024 20:31, prof. RNDr. Jiří Šponer, DrSc., učo 28764
Plný text práce
28 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
30. 4. 2024
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. RNDr. Jiří Šponer, DrSc., učo 28764
NCBR PřF MU

Oponenti

doc. RNDr. Petr Jurečka, Ph.D.
ext ÚBioch Chem PřF MU, Univerzita Palackého v Olomouci
Mgr. Stanislav Kozmon, Ph.D.
ext PřF MU, Chemický ústav SAV, v. v. i., Bratislava
doc. Ing. Filip Lankaš, PhD.
ext PřF MU, University of Chemistry and Technology Prague
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Vědy o živé přírodě

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.