Diplomová práce

Analýza struktury mozkové kůry pomocí zobrazovacích metod založených na magnetické rezonanci

Cerebral cortex analysis using magentic resonance imaging methods

Bc. Jakub Jamárik, učo 461084
Anotace

Současné konvenční metody magnetické rezonance nemají rozlišení potřebná pro separaci kortikálních vrstev mozku in vivo. Tato omezení lze obejít použitím multi-IR (inversion recovery) zobrazování, následovaným modifikovanou T1 mapovací analýzou. Tato práce si klade za svůj cíl analyzovat data získaná experimentální sekvencí a dosáhnout oddělení kortikálních vrstev v doméně spin-mřížkové (T1 relaxace …více

Abstract

Current conventional magnetic resonance imaging methods do not possess the resolutions required for the in vivo delineation of the cortical layers. These limitations could be circumvented by the usage of the experimental multi-IR (inversion recovery) imaging, followed by a modified T1 mapping analysis. This thesis aims to analyze the data acquired by the experimental sequence and achieve the separation …více

Klíčová slova
mozková kůra kortikální vrstvy MRI echo-planární zobrazování optimalizace cerebral cortex cortical layers echo-planar imaging optimization
Zadání práce
Ačkoli rozlišení konvenčních tomografů založených na magnetické rezonanci (MR) neumožňuje zobrazení jednotlivých kortikálních vrstev, objevilo se v poslední době několik prací, které prokázaly schopnost detekovat obrazové rysy specifické pro určité kortikální vrstvy. Cílem této diplomové práce je analyzovat data získaná pomocí experimentální MR pulsní sekvence (multi inversion recovery), a dosáhnout tak separace vrstev mozkové kůry nikoli v prostorové doméně, ale v doméně spin-mřížkové (T1) relaxace. Diplomant(ka) bude řešit tyto konkrétní úkoly:
  • studium problematiky a rešerše literatury v oblasti zobrazování struktury mozkové kůry pomocí magentické rezonance,
  • předzpracování dat získaných měřením - echoplanárním zobrazováním,
  • analýza dat: (a) modelováním křivky vyjadřující průběh magnetizace a (b) vizualizace směsi vrstev kůry pomocí klasifikace
Pro řešení praktické části diplomové práce využije student(ka) prostředí MATLAB a dostupné balíčky funkcí.

Doporučená literatura:

  • Lifshits S, Tomer O, Shamir I, et al. Resolution considerations in imaging of the cortical layers. NeuroImage 164:112-120, 2018.
  • Shamir I, Tomer O, Baratz Z, et al. A framework for cortical layer composition analysis using low resolution T1 MRI images. Brain Struct Funct. 224(4):1457-1467. 2019.
  • Trampel T, Bazin PL, Pine K, Weiskopf N. In-vivo magnetic resonance imaging (MRI) of laminae in the human cortex. NeuroImage, 197:707-715. 2019.

Administrativní informace
Práce zkontrolována:
1. 6. 2021 10:55, prof. Ing. Daniel Schwarz, Ph.D., učo 195581
Plný text práce
2,5 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
23. 6. 2021
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. Ing. Daniel Schwarz, Ph.D., učo 195581
USM Teorie LF MU

Oponent

Ing. Martin Lamoš, Ph.D., učo 234660
NEU6 CN CEITEC MU

Konzultanti

Mgr. Vendula Churová
stud LF MU
Ing. Lubomír Vojtíšek, PhD., učo 118501
MAFIL CN CEITEC MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Epidemiologie a modelování

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.