Diplomová práce

Analýza mitogenomu pomocí metod NGS

Analysis of mitogenome using NGS methods

Bc. Ondřej Vaculík
Anotace

Mitochondriální DNA je díky svým vlastnostem velmi důležitým genetickým markerem ve zkoumání lidské minulosti. Výzkum mitogenomu tradičně spočíval v sekvenování hypervariabilních regionů pomocí Sangerova sekvenování. Výpovědní hodnota tohoto typu analýz je však omezena krátkou délkou hypervariabilních oblastí. Bylo zjištěno, že až 70 % sekvenční variability se u některých haploskupin nachází v kódujícím …více

Abstract

By its properties, mitochondrial DNA is a very significant genetic marker in the exploration of the human past. Mitogenome research was traditionally based on the sequencing of hypervariable regions with Sanger sequencing. However, the notice value of this kind of analyses is restricted by the short length of these regions. It has been found out that up to 70 % of the sequence variability lies in the …více

Klíčová slova
aDNA mtDNA mitogenom NGS HTS MPS obohacení hybridizací bioinformatická analýza aDNA mitogenome hybridization enrichment bioinformatical analysis
Zadání práce
Student/ka v rámci zpracování diplomové práce vymyslí, zavede a zoptimalizuje protokol pro sekvenování mitogenomu metodou sekvenování nové generace. Součástí práce bude také „pipeline“ pro hodnocení získaných dat. Doporučená literatura: Knapp M., Hofreiter M. 2010. Next generation sequencing of ancient DNA: requirements, strategies and perspectives. Genes, 1(2), 227-243. Paijmans J. L., Gilbert M. T. P., Hofreiter M. 2013. Mitogenomic analyses from ancient DNA. Molecular phylogenetics and evolution, 69(2), 404-416.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
10. 5. 2019 09:29, Mgr. et Mgr. Kristýna Brzobohatá, Ph.D.
Plný text práce
2,4 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
10. 6. 2019
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. et Mgr. Kristýna Brzobohatá, Ph.D.
ÚEB Biol PřF MU

Oponent

doc. Mgr. Tomáš Zeman, Ph.D., učo 222918
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Experimentální biologie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.