Bakalářská práce

Analýza mitochondriální DNA z historického kosterního materiálu metodami sekvenace nové generace

Analysis of mitochondrial DNA from the historical skeletal material using new generation sequencing methods

Ondřej Vaculík
Anotace

Již samotné zavedení metod sekvenování nové generace způsobilo ve výzkumu starobylé DNA revoluci. Během posledních deseti let bylo vyvinuto a zdokonaleno mnoho metod, jejichž zásluhou se podařilo získat nejen mitochondriální, ale i jaderné sekvence ze vzorků, u nichž by to dříve nebylo možné. Tato práce je zaměřena na shrnutí problematiky okolo analýzy molekul starobylé DNA pomocí sekvenování nové …více

Abstract

The very introduction of new generation sequencing methods caused revolution in ancient DNA research. Many methods have been developed and improved during the last ten years, thanks to them it has been possible to obtain not only mitochondrial, but also nuclear sequences from specimens, in which it had not been possible before. This bachelor’s thesis is focused on summarizing issue of ancient DNA molecules …více

Klíčová slova
aDNA mtDNA mitogenom sekvenování nové generace NGS bioinformatická analýza mitogenome new generation sequencing bioinformatical analysis
Zadání práce
Cílem bakalářské práce na téma Analýza mitochondriální DNA z historického kosterního materiálu metodami sekvenace nové generace bude literární rešerše na dané téma. Řešitel shrne dosavadní stav problematiky u recentní DNA a především aplikace NGS na analýzu mitogenomu u starobylé DNA (aDNA). Ze získaných informací navrhne postup, který by bylo v budoucnu možno aplikovat v Laboratořích biologické a molekulární antropologie. Literatura: MOUTTHAM, Nathalie, et al. Surveying the repair of ancient DNA from bones via high-throughput sequencing. BioTechniques, 2015, 59.1: 19. MALMSTRÖM, Helena, et al. Ancient mitochondrial DNA from the northern fringe of the Neolithic farming expansion in Europe sheds light on the dispersion process. Phil. Trans. R. Soc. B, 2015, 370.1660: 20130373. ÁVILA ARCOS, María C., et al. Comparative performance of two whole genome capture methodologies on ancient DNA Illumina libraries. Methods in Ecology and Evolution, 2015, 6.6: 725-734.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
12. 5. 2017 11:17, Mgr. et Mgr. Kristýna Brzobohatá, Ph.D.
Plný text práce
1,7 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
1. 6. 2017
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. et Mgr. Kristýna Brzobohatá, Ph.D.
ÚEB Biol PřF MU

Oponent

Mgr. Nikola Tom, Ph.D.
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Experimentální biologie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.