Diplomová práce

16S rDNA jako nástroj k určování ústní mikroflóry u historických populací

16S rDNA as a determination tool for oral microflora of ancient populations

Bc. Lenka Skopalová
Anotace

V této diplomové práci byl zaveden postup analýzy 16S rDNA z historického zubního kamene na sekvenační platformě Illumina. U 16 vzorků, pocházejících z velkomoravské lokality Znojmo – Hradiště, byly analyzovány variabilní oblasti V1 a V6 genu 16S rDNA. Po optimalizačním kroku byly vzorky sekvenovány metodou NGS (tj. metodou sekvenování nové generace) a výsledná data byla porovnána se studiemi zabývající …více

Abstract

In this diploma thesis was introduced the procedure of analysis of 16S rDNA from historical dental calculus on the Illumina sequencing platform. In 16 samples coming from the Great Moravian locality of Znojmo – Hradiště, variable areas V1 and V6 of the 16S rDNA gene were analyzed. After the optimization step, the samples were sequenced using the NGS method (Next Generation Sequencing), and the resulting …více

Klíčová slova
16S rDNA zubní kámen aDNA Illumina starobylý zubní kámen NGS dental calculus ancient dental calculus
Zadání práce
Gen pro 16S ribozomální RNA je díky hypervariabilním oblastem vhodný pro identifikaci mikroorganismů. Pomocí metagomických přístupů je tak možné zkoumat nejen recentní, ale i starobylé vzorky s velkým množstvím bakterií. Velkou výhodou analýzy tohoto genu jsou dobře přístupné a vybavené databáze, které zatím kvalitou převyšují i tzv. shotgun přístup. V ústní dutině již bylo nalezeno přes 700 druhů bakterií. Jedinou možností, jak přímo zkoumat ústní mikroflóru u historických populací je molekulární analýza jejich zubního kamene. Cílem diplomové práce bude zavést analýzu 16S rDNA z historického zubního kamene na sekvenační platformě Illumina (případně na jiných NGS platformách).
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
16. 5. 2022 16:01, Mgr. Dana Buriánková Fialová, Ph.D., učo 184570
Plný text práce
1,5 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
10. 6. 2022
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Dana Buriánková Fialová, Ph.D., učo 184570
Genet ÚEB Biol PřF MU

Oponent

Mgr. Lucie Škorpíková, Ph.D., učo 357379
Paraz ÚBZ Biol PřF MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Biologie člověka

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.