Bakalářská práce

Analýza PIWI-interagujících RNA u pacientů s multiformním glioblastomem

Analysis of PIWI-interacting RNAs in glioblastoma multiforme patients

František Siegl, učo 451857
Anotace

Multiformní glioblastom (GBM) je nejčastějším gliálním nádorem mozku s velmi ne-přížnivou prognózou. Navzdory pokrokům v neurochirurgii a onkologii je medián přežití pacientů s GBM jenom 12 až 15 měsíců od stanovení diagnózy. V posledních letech jsou tak nemalé materiální prostředky a úsilí věnovány výzkumu jak nových diagnostických, prognostických a prediktivních biomarkerů, tak potenciálních terapeutických …více

Abstract

Glioblastoma multiforme is the most frequent tumor of glial cells with a very poor prognosis. Despite the progress in neurosurgery and therapy, the median survival of patients with GBM is only 12 to 15 months from diagnosis. In recent years, a lot of effort and financial resources are spent on the research of new diagnostic, prognostic and predictive biomarkers, as well as potential therapeutic targets …více

Zadání práce
Multiformní glioblastom (GBM) je nejčastějším primárním nádorem mozku s mediánem přežití přibližně 13 měsíců od stanovení diagnózy. Ačkoliv se prognóza u jednotlivých pacientů značně liší, histopatologická vyšetření nejsou schopna individuální riziko předem odhadnout. Proto je velice důležité najít nové molekulární biomarkery umožňující predikovat u pacientů s GBM klinickou odpověď a pomoci tak více individualizovat jejich léčbu. Jedním z nejmodernějších přístupů molekulární charakterizace solidních nádorů je analýza nekódujících RNA, mezi které patří i krátké jednořetězcové RNA dlouhé 24-32 nukleotidů interagující s PIWI proteiny (PIWI-interacting RNA, piRNA). Ačkoliv se jedná o doposud nepříliš prozkoumanou skupinu, je již znám její významný podíl na udržování genomové stability skrze tlumení aktivity transponovatelných elementů mechanismem vzájemné interference piRNA a cílové molekuly. PiRNA jsou doposud nejvíce prostudovány ve vztahu k biologii zárodečných buněk, avšak nedávné studie prokázaly, že tyto molekuly hrají rovněž významnou roli v kancerogenezi a mohly by tak představovat jak nové potenciální terapeutické cíle, tak diagnostické biomarkery. Cílem bakalářské práce bude analyzovat globální expresní profil piRNA v GBM pomocí technologie sekvenování nové generace (NGS) a následně validovat expresi vybraných piRNA na nezávislém souboru vzorků tkáně GBM. Současně budou získaná data integrována pomocí statistických nástrojů s klinicko-patologickými parametry za účelem identifikace piRNA s prognostickým a prediktivním významem odpovědi na léčbu u pacientů s GBM.
Práce zkontrolována:
9. 6. 2018 10:52, doc. Mgr. Jiří Šána, Ph.D., učo 184506
Plný text práce
2,9 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
13. 6. 2018
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. Mgr. Jiří Šána, Ph.D., učo 184506
MOnkII CMM CEITEC MU

Oponent

doc. MUDr. Pavel Fadrus, Ph.D., učo 56088
NCHKB FN Bohunice LF MU

Konzultant

Mgr. Marek Večeřa, Ph.D., učo 393400
MOnkII CMM CEITEC MU

Literatura

  • ŠÁNA, Jiří; Petra FALTEJSKOVÁ; Marek SVOBODA a Ondřej SLABÝ. Novel classes of non-coding RNAs and cancer. Journal of Translational Medicine. London, England: BIOMED CENTRAL LTD, 2012, roč. 10, May, s. "nestránkováno", 21 s. ISSN 1479-5876. Dostupné z: https://doi.org/10.1186/1479-5876-10-103.
  • RYBECKÁ, Silvia; Karolína ŠTÍTKOVCOVÁ; Petra VYCHYTILOVÁ a Ondřej SLABÝ. Zapojení PIWI-interagujících RNA do procesů kancerogeneze prostřednictvím regulace genové exprese. Klinická onkologie. Brno: Česká Lékařská Společnost J.E. Purkyně, 2016, roč. 29, č. 6, s. 428-438. ISSN 0862-495X. Dostupné z: https://doi.org/10.14735/amko2016428.

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.