Diplomová práce

Charakterizace histonového chaperonu ASF1 a molekulární interakce s proteinem Codanin1

Characterization of histone chaperone ASF1 and the molecular interplay with Codanin1

Bc. Eva Pospíšilová, učo 505981
Anotace

Organizace chromatinu, kterou zprostředkovávají histonové chaperony, jako je ASF1a, je nezbytná pro stabilitu genomu a správnou buněčnou funkci. Předpokládá se, že deregulace interakcí proteinů ASF1a a Codanin1 se podílí na vrozené dyserytropoetické anémii typu I, nemoci vyznačující se defekty chromatinu. V této práci byly charakterizovány varianty ASF1a – plno délková („full-length“) ASF1a FL, zkrácená …více

Abstract

Chromatin organization, mediated by histone chaperones like ASF1a, is essential for genome stability and proper cellular function. Dysregulation of ASF1a-Codanin1 interac-tions is supposed to be implicated in Congenital Dyserythropoietic Anemia Type I, a disor-der marked by chromatin defects. We characterized ASF1a variants – full-length ASF1a FL, truncated ASF1a 154aa, and cysteine-mutant ASF1a C202S …více

Klíčová slova
Histonové chaperony ASF1 vrozená anemie Codanin1 oligomerizace protein-proteinové interakce Histone chaperones Congenital dyserythropoietic anemia oligomerization protein-protein interactions
Zadání práce
Cílem této diplomové práce je charakterizovat molekulární interakce mezi histonovým chaperonem ASF1 a proteinem Codanin1, dvěma regulátory struktury chromatinu a replikace DNA. Codanin1 je životně důležitý a evolučně konzervovaný protein, který reguluje ukládání histonů prostřednictvím interakce s ASF1. Deregulace této dráhy se podílí na vrozené dyserytropoetické anémii typu I (CDA-I). Nedávné studie ukázaly, že Codanin1 zadržuje ASF1 v cytoplazmě, čímž omezuje přenos histonů do jádra a moduluje sestavení chromatinu. Podrobný molekulární mechanismus, který je základem této regulace, však dosud nebyl plně objasněn.

Studentka využije multidisciplinární přístup kombinující molekulární klonování, proteinovou biochemii a techniky buněčné biologie ke zkoumání interakce mezi proteiny ASF1 a Codanin1.
 
Hlavní cíle práce:
  • Klonování a příprava proteinů ASF1 a Codanin1.
  • Biochemická a biofyzikální charakterizace proteinů ASF1 a Codanin1.
  • Experimenty popisující lokalizaci proteinů ASF1 a Codanin1 v buňkách.
Dílčí úkoly budou upraveny na základě získaných vědeckých poznatků a aktuálních možnostech výzkumu v laboratoři.

Literatura:
1. Hammond, C. M., Strømme, C. B., Huang, H., Patel, D. J. & Groth, A. Histone chaperone networks shaping chromatin function. Nature Reviews Molecular Cell Biology 2017 18:3 18, 141–158 (2017).
2. Sedor, S. F. & Shao, S. Mechanism of ASF1 engagement by CDAN1. Nature Communications 2025 16:1 16, 1–13 (2025).
3. Jeong, T.-K. et al. CODANIN-1 sequesters ASF1 by using a histone H3 mimic helix to regulate the histone supply. Nature Communications 2025 16:1 16, 1–17 (2025).
4. Ask, K. et al. Codanin-1, mutated in the anaemic disease CDAI, regulates Asf1 function in S-phase histone supply. EMBO Journal 31, 2013–2023 (2012).
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
16. 5. 2025 15:20, Mgr. Tomáš Brom, Ph.D., učo 436685
Plný text práce
1,7 MB / soubor PDF

Upozornění:

Část závěrečné práce byla v souladu s § 47b zákona o vysokých školách skryta z důvodu překážky pro její zveřejnění do 12. 5. 2030.

Odůvodnění: Zveřejnění částí této závěrečné práce týkající se kapitol 5. až 7. a Přílohy je z důvodu dosud nepublikovaných dat odloženo na dobu 5 let.

Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
10. 6. 2025
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. Mgr. Ctirad Hofr, Ph.D., učo 7807
NCBR PřF MU
Mgr. Tomáš Brom, Ph.D., učo 436685
NCBR PřF MU

Oponent

Mgr. Jan Komárek, Ph.D., učo 175127
NCBR PřF MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Genomika a Proteomika

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.