Diplomová práce

Vizualizace projevů tauopatie pomocí in situ kryo-elektronové tomografie

Visualizing tauopathy with in situ cryo-electron tomography

Bc. Jaroslav Straník
Anotace

Tato diplomová práce se zabývá vizualizací patologie Tau proteinu v buněčných modelech pomocí pokročilé metody in situ kryo-elektronové tomografie (kryo-ET). Alzheimerova choroba, nejčastější forma demence, je úzce spojena s patologickými agregáty Tau proteinu, které se podílejí na rozvoji neurodegenerace. Pomocí modelů buněčných linií SH-SY5Y AT Tau (AA 151–391 4R) a HEK293T Tau RD (AA 244–368) P301S …více

Abstract

This diploma thesis focuses on the visualisation of Tau protein pathology in cellular models using the advanced method of in situ cryo-electron tomography (cryo-ET). Alzheimer’s disease, the most common form of dementia, is closely associated with pathological Tau protein aggregates contributing to neurodegeneration. Using SH-SY5Y AT Tau (AA 151–391 4R) and HEK293T Tau RD (AA 244–368) P301S FRET Biosensor …více

Zadání práce
Tauopatie jsou neurodegenerativní onemocnění spojená s misfoldingem a agregací tau proteinu do toxických oligomerů a tvorbou nerozpustných neurofibrilárních depozitů. Poruchy ve funkci tau proteinu a buněčná toxicita tau fibril mají negativní dopad na intracelulární transport, narušují energetický metabolismus, způsobují abnormality v degradačních procesech neuronů a vedou k poruchám přenosu vzruchů synapsemi. Přestože víme, že k těmto poruchám buněčných procesů dochází, není zcela jasné, jaký je jejich mechanismus a jakou roli v nich tau přesně hraje. Jednou z cest k lepšímu pochopení mechanismů buněčných změn způsobených tauopatiemi, je přímá vizualizace pomocí technik in situ kryo-elektronové mikroskopie, dovolující rozlišení v jednotkách nanometrů. Náplň diplomové práce je vizualizace procesů odehrávajících se v neuronech v důsledku působení patologických tau proteinových fibril pomocí in situ kryo-elektronové tomografie a fluorescenční mikroskopie s cílem popsat internalizaci tau fibril do buňky a vztahy mezi tau fibrily a organelami (cytoskeletem, mitochondriemi a degradačním aparátem buňky). Díky získaným datům bude možné ověřit a rozšířit existující hypotézy o mechanismech tauopatie, například zda sekvestrací tau do fibril opravdu dochází k destabilizaci mikrotubulů a jejich rozpadu, nebo zjistit jakým způsobem je narušen degradační proces tau fibril. Jako model neuronů budou použity neuroblastomy a případně jiné buněčné modely. Harmonogram 2023/2024 - Literární rešerše, značení tau proteinových fibril, optimalizace internalizace fibril, ověření internalizace pomocí fluorescenční mikroskopie. 2024/2025 - Příprava buněčných lamel, sběr tomografických dat, rekonstrukce a segmentování tomogramů, vyhodnocení dat, sepsání práce
Práce zkontrolována:
24. 5. 2025 00:59, doc. RNDr. Martin Vácha, Ph.D., učo 1376
Plný text práce
15,1 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
26. 6. 2025
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Dr. rer. nat. Hana Nedozrálová, učo 409261
BNMRS CSB CEITEC MU

Oponent

Mgr. Jana Moravcová, Ph.D., učo 52570
CryoEM CSB CEITEC MU

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.