Diplomová práce

Studium interakcí peptidů s organickými molekulami metodami molekulového modelování

Study of interactions between proteins and organic molecules using molecular modeling methods

Bc. Daniela Machová
Anotace

Tato diplomová práce je zaměřena na studium konformačního chování amyloidu β, který je tvořen v průběhu Alzheimerovy choroby. V první teoretické části této práce je souhrn dostupných znalostí o amyloidu β a cholinergními systému. K symptomatické léčbě Alzheimerovy choroby se využívá takrin a 7-methoxytakrin působící terapeuticky tím, že inhibují cholinesterasy a zvyšují tak hladinu acetylcholin. Choliesterasa …více

Abstract

This diploma thesis is focused on the study of conformational behavior of amyloid β, which is created during Alzheimer's disease. In the first theoretical part of this work is summary of available knowledge about the amyloid β and the cholinergic system.For the symptomatic treatment of Alzheimer's disease are used tacrin and 7-methoxytacrin, which cause therapeutically by inhibiting cholinesterase …více

Zadání práce
Amyloidy beta hrají klíčovou roli při neurodegenerativních onemocněních jako je například Alzheimerova choroba. Dřívější studie byly zaměřeny zejména na extracelulární deposici fibril a plaků. Tyto peptidy jsou schopné na sebe vázat mnoho dalších organických molekul jako je například cholesterol a jeho deriváty. Cílem této práce bude ověřit schopnost amyloidů vázat na sebe molekuly takrinu a jeho derivátů. Pro studium bude použito metod molekulového dokování a molekulové dynamiky. Pro energetické ohododnocení stability budou použity metody MM/PBSA a MM/GBSA implementované v programovém balíku Ambertools.
Práce zkontrolována:
19. 5. 2015 13:22, Mgr. Zdeněk Kříž, Ph.D.
Plný text práce
41,4 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
24. 6. 2015
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Zdeněk Kříž, Ph.D.
NCBR PřF MU

Oponent

Mgr. Stanislav Kozmon, Ph.D.

Literatura

  • KRIŠTOFÍKOVÁ, Zdena; Zdeněk KŘÍŽ; Daniela ŘÍPOVÁ a Jaroslav KOČA. Interactions of Amyloid beta Peptide 1 - 40 and Cerebrosterol. Neurochemical Research. New York: Springer / Plenum Publishers, 2012, roč. 37, č. 3, s. 604-613. ISSN 0364-3190. Dostupné z: https://doi.org/10.1007/s11064-011-0650-8.

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.