Diplomová práce

Studium konformačního chování amyloidu beta a jeho mutantů v pozici 35 metodami molekulového modelování

Conformational study of amyloid beta and its mutants at position 35 using molecular modeling methods

Bc. Libuše Dvořáková
Anotace

Alzheimerova choroba je závažné onemocnění, které postihuje mozek lidí v pokročilém věku života. Existuje mnoho teorií, jež se snaží vysvětlit cesty vedoucí k patologickým změnám v mozku pacientů, ale dosud žádná z nich nedokáže popsat přesný mechanismus vzniku tohoto onemocnění. Jednou z teorií poslední doby je i teorie o nepříznivém působení volných kyslíkových radikálů na organizmus a jejich vlivu …více

Abstract

Alzheimer's disease is a serious disease that affects the human brain in the senior age. There are many theories trying to explain the path leading to pathological changes in the brain of patients, but none of them can describe the exact mechanism of the disease so far. One of the recent theories is the one of the negative effects of free oxygen radicals on the organism and their influence on the development …více

Klíčová slova
Alzheimerova choroba amyloid beta oxidativní stres molekulové modelování molekulová mechanika molekulová dynamika Alzheimer´s disease oxidative stress molecular modeling molecular mechanics molecular dynamics
Zadání práce
1. Proveďte literární rešerši na téma role methioninu v pozici 35 amyloidu beta v oxidativním stressu. 2. Proveďte MD simulace nativního amyloidu beta (1-42) a mutace v poloze 35. Aminokyselinu methionin zaměňte postupně za alanin, valin, cystein, norleucin. Každou simulaci proveďte dvakrát s rozdílným rozložením zrychlení jednotlivých atomů. 3. Proveďte analýzu získaných trajektorií z hlediska stability simulací, stability sekundárních struktur a možných vnitřních vodíkových vazeb. 4. Porovnejte výsledky jednotlivých simulací ve vztahu k datům získaných z literatury.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
11. 5. 2015 15:28, Mgr. Zdeněk Kříž, Ph.D.
Plný text práce
4,4 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
10. 2. 2016
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Zdeněk Kříž, Ph.D.
NCBR PřF MU

Oponent

Mgr. Stanislav Kozmon, Ph.D.
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biochemie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.