Bakalářská práce

Šum v alternativním sestřihu u rostlin

The noise in alternative splicing in plants

Yuliia Mironova, učo 461304
Anotace

Vývoj technik molekulární biologie odhalil mimořádnou komplexitu v transkriptomech většiny eukaryontních organizmů. Usuzuje se, že pozorovaná komplexita je z velké části zajištěná alternativním sestřihem. Podle transkriptomických studií se odhaduje, že alternativnímu sestřihu u člověka podléhá více než 95 % multiexonových genů a u Arabidopsis thaliana více než 61 % multiexonových genů. V posledním …více

Abstract

Development of the molecular biology technics uncovered surprising complexity of the majority of eukaryotic transcriptomes. Observed complexity was thought to be mostly due to the alternative splicing. 95 % of the human multi-exonic genes and almost 61 % of the multi-exonic genes of Arabidopsis thaliana are estimated to undergo alternative splicing. In the recent decade, the idea that most of the observed …více

Klíčová slova
Alternativní sestřih Arabidopsis thaliana mRNA transkriptomika proteomika translatomika NGS MS/MS NMD šum v alternativním sestřihu duplikace genů konzervovanost alternativního sestřihu selekční tlak genetický drift komplexita organizmu Alternative splicing transcriptomics proteomics translatomics noise in alternative splicing gene duplication alternative splicing conservation selection pressure genetic drift organism complexity
Zadání práce
Pokrok sekvenačních technik v posledních letech odhalil mimořádnou komplexitu v transkriptomech eukaryot. Za značnou část této komplexity je zodpovědný alternativní sestřih. Uvádí se, že více než 95 % lidských a 70 % genů rostlinných tomuto procesu podléhá. Funkční analýzy však nasvědčují, že ne všechny takto nalezené transkripty mají fyziologický význam. Úkolem této práce bude zjistit stav poznání problematiky tzv. sestřihového šumu v savčích (a dalších) systémech a pokusit se implikovat zjištěné poznatky na modelové organizmy rostlinné.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
20. 5. 2019 15:35, Mgr. Kamil Růžička, Dr. rer. nat., učo 118154
Plný text práce
3,1 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
11. 6. 2019
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Kamil Růžička, Dr. rer. nat., učo 118154
ext NCBR PřF MU

Oponent

Karel Müller
Ústav experimentální botaniky AV ČR Rozvojová 263 165 02 Praha 6 – Lysolaje

Konzultant

prof. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D., učo 2658
NCBR PřF MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Experimentální biologie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.