Bakalářská práce

Denitrifikace u jednooxidasových kmenů Paracoccus denitrificans

Denitrification in one-oxidase strains of Paracoccus denitrificans

Marek Dvořák
Anotace

Tato práce se zabývá metabolismem bakterie Paracoccus denitrificans, v teoretické části shrnuje poznatky o propojení aerobní a anaerobní respirace (denitrifikace) a o její regulaci. Praktická část přináší výsledky experimentální práce, při které byly mutantní kmeny s pouze jednou terminální oxidasou inkubovány spolu s divokým kmenem v aerobním a anaerobním prostředí. U dvou z nich byla zjištěna schopnost denitrifikovat ve větší míře i za přístupu vzduchu.

Abstract

This thesis deals with metabolism paths of Paracoccus denitrificans. The theoretical part summarizes knowledge about connection between aerobic and anaerobic respiration (denitrification) and its regulation. In experimental part were researched the mutant strains of P. denitrificans. These strains contain only one of three terminal oxidases. They were incubated under aerobic and anaerobic conditions and at two of these strains occured unusual aerobic denitrification.

Klíčová slova
Denitrification Paracoccus denitrificans HPLC nitrate nitrite cytochrome c aa3 oxidase cytochrome c cbb3 oxidase quinoloxidase denitrifikace dusičnan dusitan cytochrom c aa3 oxidasa cytochrom c cbb3 oxidasa chinoloxidasa
Zadání práce
Půdní bakterie Paracoccus denitrificans vytváří rozvětvený respirační řetězec, ve kterém tři terminální oxidasy (cyt aa3, cbb3 a ba3) kompetují o přítok redukčních ekvivalentů s enzymy denitrifikační dráhy. Cílem práce bude zjistit, jak se tato kompetice změní po genetické inaktivaci dvou z těchto oxidas inzerční mutagenezí. V teoretické části své práce by student měl na základě vlastní literární rešerše shrnout známé údaje o enzymech denitrifikační dráhy, jejich začlenění do bakteriálních respiračních řetězců a o stanovení aniontů dusičnanu a dusitanu pomocí HPLC. V praktické části budou divoký kmen a kmeny mutantní, jež obsahují pouze jednu z terminálních oxidas, nejprve kultivovány anaerobně s dusičnanem jako terminálním akceptorem elektronů, aby se vytvořily enzymy denitrifikační dráhy. Získané buňky pak budou inkubovány v nerůstových podmínkách s dusičnanem jednak anaerobně a jednak aerobně a v odebíraných vzorcích bude stanovován obsah dusičnanu a dusitanu pomocí HPLC. Následně se určí rozsah uplatnění denitrifikace, jenž vyplývá z časového úbytku součtu obou koncentrací. V diskusi autor porovná své výsledky pro jednotlivé kmeny a pokusí se vysvětlit pozorované rozdíly.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
16. 5. 2013 06:03, prof. RNDr. Igor Kučera, DrSc., učo 911
Plný text práce
1,1 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
18. 6. 2013
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. RNDr. Igor Kučera, DrSc., učo 911
ÚBioch Chem PřF MU

Oponent

Autor posudku dosud neidentifikován.

Konzultant

Mgr. Vojtěch Sedláček, Ph.D., učo 21931
ÚBioch Chem PřF MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biochemie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.