Bakalářská práce

Genové rozdíly mezi pravlky a vlky

Genetic differences between dire and grey wolves

Pavlína Prombergerová
Anotace

Cílem této práce bylo posoudit genetickou podobnost mezi pravlkem obrovským a severoamerickým vlkem obecným a určit genové rozdíly mezi oběma druhy. K analýze byla využita veřejně dostupná sekvenační data, která byla po kontrole kvality mapována na referenční genom psa. Následně byly vyvolány jednonukleotidové polymorfismy a pomocí metody genomové polarizace identifikovány diagnostické varianty a fixované …více

Abstract

The aim of this thesis was to assess the genetic similarity between the dire wolf and the North American grey wolf and to identify genomic differences between the two species. Publicly available sequencing data were used for the analysis, and after quality control the reads were mapped to the dog reference genome. Single nucleotide polymorphisms were subsequently called, and diagnostic variants and …více

Klíčová slova
pravlk obrovský genomová polarizace SNP de‑extinction diem dire wolf genome polarization
Zadání práce
Soukromá biotechnologická společnost na jaře 2025 ohlásila „oživení“ vyhynulých pravlků obrovských. Štěňata vzniklá genetickým inženýrstvím jsou vlci obecní (Canis lupus), do jejichž genomu bylo vloženo přibližně 20 cílených změn ve 14 genech pravlka obrovského (Aenocyon dirus). Cílem této bakalářské práce je prozkoumat genetickou podobnost mezi pravlkem a vlkem obecným pomocí metody genomové polarizace a kvantifikovat počet genů s fixovanými rozdíly mezi těmito druhy.
  1. Student stáhne sekvenační čtení všech dostupných pravlků z veřejných databází a namapuje je na referenční genom.
  2. Tato data následně spojí s již zpracovanými genomy severoamerických vlků obecných a vyvolá jednonukleotidové polymorfismy.
  3. Pomocí metody genomové polarizace určí diagnostické varianty a identifikuje geny, ve kterých se vyskytují fixované rozdíly mezi pravlkem a vlkem.
  4. Výsledky interpretuje ve světle současného pokusu o "vzkříšení" vyhynulého druhu.
Literatura:

Baird S. J. E., Petružela J., Jaroň I., Škrabánek P., Martínková N. 2023. Genome polarisation for detecting barriers to geneflow. Methods in Ecology and Evolution, 14, 512–528.

Gedman, G. L., Morrill Pirovich, K., Oppenheimer, J., Hyseni, C., Cassatt-Johnstone, M., et al. 2025. On the ancestry and evolution of the extinct dire wolf. bioRxiv. https://doi.org/10.1101/2025.04.09.647074.

Administrativní informace
Práce zkontrolována:
13. 5. 2026 08:32, doc. Mgr. Natália Martínková, Ph.D., učo 103641
Plný text práce
1,8 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
23. 6. 2026
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. Mgr. Natália Martínková, Ph.D., učo 103641
RECETOX PřF MU

Oponent

Mgr. Patrícia Chrzanová Pečnerová, PhD
University of Copenhagen, Faculty of Science, Department of Biology, Computational and RNA Biology
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Biomedicínská bioinformatika

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.