Diplomová práce

Kvantitativní proteomická analýza histonových kódů

Quantitative proteomic analysis of histone codes

Bc. Pavlína Dobrovolná
Anotace

Posttranslační modifikace histonů mají zásadní vliv na strukturu a dynamiku chromatinu, čímž se podílí na regulaci mnoha buněčných procesů. Epigenetické změny chromatinu jsou spojovány např. i se vznikem nádorových onemocnění. Proto je výzkum těchto procesů důležitý pro jejich pochopení, i možnost diagnostiky nemocí, či vývoje vhodných léčiv. Aktuálně je pro výzkum posttranslačních modifikací histonů …více

Abstract

Post-translational modifications of histones have fundamental effects on the structure and dynamics of chromatin, thereby contributing to the regulation of many cellular processes. Epigenetic changes of chromatin are associated, for example, with the formation of cancer. Therefore, research of these processes is important for their understanding, as well as the possibility of diagnosing diseases or …více

Zadání práce
Proteomika založená na hmotnostní spektrometrii je cenným nástrojem pro identifikaci a kvantifikaci histonových modifikací. Vzhledem ke komplexitě histonových variant a kombinatorice jejich posttranslačních modifikací je studium histonových kódů stále obtížné. Metodické přístupy prodělávají neustálý vývoj směrem k identifikaci pozičních izomerů a možnosti jejich kvantifikace. Student se v rámci diplomové práce bude zabývat vývojem analytických přístupů pro charakterizaci posttranslačních modifikací histonů hmotnostní spektrometrií. Tyto metodické přístupy bude následně aplikovat pro studium histonových kódů v modelových organizmech s cílem porozumět jejich roli v určitých fyziologických kontextech. Téma zahrnuje škálu metodických postupů od zpracování biologického materiálu, přes chemickou derivatizaci histonových extraktů, po analýzu hmostnostní spektrometrií a zpracování dat. Diplomová práce bude vypracována na pracovišti Výzkumná skupina Zbyňka Zdráhala, CEITEC-MU (budova A26, UKB Bohunice).
Práce zkontrolována:
17. 6. 2020 13:50, Mgr. Gabriela Lochmanová, Ph.D., učo 15496
Plný text práce
2,5 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
8. 7. 2020
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Gabriela Lochmanová, Ph.D., učo 15496
ÚBioch Chem PřF MU

Oponent

doc. Mgr. Jan Havliš, Dr., učo 743
NCBR PřF MU

Konzultant

prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr., učo 34759
ÚBioch Chem PřF MU

Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biochemie
  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.