Master's thesis

Repeatome evolution in the tribe Boechereae (Brassicaceae)

Evoluce repetitivnich sekvenci v tribu Boechereae (brukvovité)

Bc. Stanislav Kostiuk, UČO 481262
Abstract

Ačkoliv byla repetitivní DNA objevena již v roce 1968, její struktura a role v eukaryotických genomech zůstávala neobjasněnou až do konce dvacátého století. Repetitivní DNA, spolu s ostatními oblastmi genomu, které nekódují proteiny, byla označována jako sobecká DNA, a u rostlin tvoří nejzastoupenější složku genomu. Díky rozvoji metod sekvenování DNA a bioinformatiky se analýza repetitivní složky genomů …more

Abstract

Although repetitive DNA was discovered as soon as in 1968, its structure and role in eukaryotic genomes remained unclear until the end of the twentieth century. Repetitive DNA, along with other non-protein-coding regions of the genome, has been referred to as selfish DNA, and in plants it constitutes the most abundant component of the genome. Thanks to the development of DNA sequencing methods and …more

Keywords
bioinformatická analýza bioinformatic analysis Boechera evoluce genomu genome evolution Hyb-Seq repeatom repeatome repetitivní DNA repetitive DNA
Thesis description
Rod Boechera (tribus Boechereae, čeleď brukvovitých), blízce příbuzný modelovému rostlinnému druhu Arabidopsis thaliana, obsahuje c. 110 druhů rozšířených především v Severní Americe. Rod Boechera zahrnuje diploidní sexuální stejně jako diploidní a triploidní apomiktické taxony. Jedná se o jediný rod v čeledi brukvovitých, kde se apomixie vyskytuje na diplodní úrovni, proto představuje významný model pro studium apomixie. Je známo, že repetitivní DNA je významným faktorem ovlivňujícím velikost a strukturu rostlinných genomů. Předmětem této diplomové práce je detailní kvalitativní a kvantitativní bioinformatická analýza repeatomů u několika desítek druhů z rodu Boechera a dalších zástupců tribu Boechereae. Cílem této studie je pochopení evoluce repetitivních sekvencí v celém tribu.
Administrative information
The thesis has been checked:
17/5/2023 14:01, RNDr. Terezie Malík Mandáková, Ph.D., UČO 64119
Full text of thesis
1 MB / file PDF
Language used
English English
Defence date
9/6/2023
The thesis was defended successfully

Supervisor

RNDr. Terezie Malík Mandáková, Ph.D., UČO 64119
Genet ÚEB Biol PřF MU

Reader

Mgr. Lucie Crhák Khaitová, Ph.D., UČO 77874
abs PřF MU
Cite this text
Masaryk University Faculty of Science
Programme
Plan
Molecular Biology and Genetics

Theses on a related topic

List of theses with an identical keyword.

Similar documents

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.