Diplomová práce

Strukturní a funkční analýza CRISPR/Cas lokusu v genomu koaguláza-negativních stafylokoků

Structural and functional analysis of CRISPR-Cas locus in genome of coagulase-negative staphylococci

Bc. Kristýna Kořená
Anotace

CRISPR/Cas systémy se vyskytují pravděpodobně u více než poloviny bakterií. Kromě jiných obranných mechanismů, jako jsou např. RM systémy, chrání bakteriální buňky před cizorodou DNA. Vzhledem k rozvoji fágové terapie roste význam zkoumání mechanismů, kterými je bakterie chráněna před fágy. CRISPR/Cas však mohou sloužit také jako nástroj pro editaci genomů. Tato diplomová práce je zaměřena na studium …více

Abstract

CRISPR/Cas systems are probably present in more than half of the bacteria. In addition to other defense mechanisms such as RM systems, CRISPR/Cas protects bacterial cells against foreign DNA. Due to the development of the phage therapy, it is increasingly important to investigate the mechanisms by which bacteria resist phages. However, CRISPR/Cas can also serve as a genome editing tool. This thesis …více

Klíčová slova
CRISPR/Cas koaguláza-negativní stafylokoky Staphylococcus petrasii obranné mechanismy horizontální přenos genů bakteriofágy coagulase-negative staphylococci defense mechanisms horizontal gene transfer bacteriophages
Zadání práce
Cílem diplomové práce bude detekovat a charakterizovat lokusy CRISPR/Cas v genomech několika kmenů koaguláza-negativních stafylokoků. Budou srovnány sekvence mezerníků u vybraného souboru kmenů deponovaných na našem pracovišti se známými sekvencemi genomů v databázích. Dále bude prověřena přítomnost cílových sekvencí systému CRISPR/Cas ve stafylokokových mobilních genetických elementech, zejména v genomech bakteriofágů a v plazmidech.Součástí práce bude rovněž příprava konstruktů pro ověření funkce CRISPR/Cas lokusu v bakteriálních buňkách.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
13. 5. 2019 08:21, prof. RNDr. Jiří Doškař, CSc., učo 2591
Plný text práce
1,8 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
6. 6. 2019
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. RNDr. Jiří Doškař, CSc., učo 2591
Pracoviště výzkumu genomu Biol PřF MU

Oponent

Mgr. Juraj Bosák, Ph.D., učo 106498
BiolÚ Teorie LF MU

Konzultant

Mgr. Pavol Bárdy, Ph.D.
Pracoviště výzkumu genomu Biol PřF MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Experimentální biologie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.