Diplomová práce

Genetická analýza šimpanzů v českých a slovenských zoologických zahradách

Genetic analysis of chimpanzees from Czech and Slovak ZOOs

Bc. Mwanahamisi Issa Mapua, M.Sc.
Anotace

Diplomová práce se zabývá populací šimpanzů v českých a slovenských ZOO, zaměřuje se na identifikaci poddruhů a rozlišení kříženců pomocí molekulárních ukazatelů, DNA. Byly identifikovány dvě skupiny, Pan troglodytes verus a Pan troglodytes troglodyets/Pan troglodytes schweinfurthii. Bylo pozorováno, že Pan troglodytes verus je geneticky odlišný od dalších poddruhů a je doporučeno tato zvířata oddělit od zbývajících skupin.

Abstract

Master thesis deals with populations of common chimpanzees in Czech and Slovak Zoos, aiming to identifiction of subspecies and determination of hybrids with the help of Molecular markers, mtDNA and microsatellites. Two groups were identified, Pan troglodytes verus and Pan troglodytes troglodyets/Pan troglodytes schweinfurthii. It was observed that Pan troglodytes verus is genetically distant to other subspecies and recommended to keep this animals separately from other groups.

Zadání práce
Zásady pro vypracování: Little is known about population genetic structure of the chimpanzees and it has resulted in frequent hybridizations between individuals of unknown origin living in captivity. The current captive breeding programmes are trying to reproduce only genetically "clear" individuals, i.e. individuals belonging to the genetically defined subspecies. However, there is a problem that most of individuals in captivity are of unknown origin and there are no genetic data about them, which prevents to use them in reproductive management. Recently, the genetic structure of wild living chimpanzees has been described by using several types of markers, including mtDNA (Gonder et al. 2006), Y-chromosome (Stone et al. 2002) and large set of microsatellites (Becquet et al. 2007). The aims of the proposed diploma thesis are following: 1) To genotype available material of chimpanzees (collected from animals in captivity) on selected microsatellites and mtDNA marker(s) 2) By using individual assignment methods and by comparison with available data, to assess the subspecific status of analysed individuals. 3) To identify the potential hybrid individuals by using Bayesian analysis of data (NewHybrid, STRUCTURE etc.) Rozsah grafických prací: Práce bude zpracována na PC, včetně grafického vyhodnocení. Rozsah průvodní zprávy: 50-80 stran včetně tabulek, obrázků a grafů, 12ti bodové písmo, pevná vazba Seznam odborné literatury: Vedoucí práce doporučí základní studijní literaturu (podle citačních zvyklostí): 1)Becquet et al., 2007: Genetic structure of chimpanzee populations. PLoS Genetics, 3(4): e66. 2)Gonder et al. 2006: New genetic evidence on the evolution of chimpanzee populations and implications for taxonomy. Int. J. Primatol., 27: 1103-1127. 3)recentní publikace v časopisech Molecular Ecology, International Journal of Primatology, Proceedings of the Royal Society B, PNAS, etc.
Práce zkontrolována:
19. 5. 2011 07:57, prof. Mgr. et Mgr. Josef Bryja, Ph.D., učo 7775
Plný text práce
1,2 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
13. 6. 2011
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. Mgr. et Mgr. Josef Bryja, Ph.D., učo 7775
ÚBZ Biol PřF MU

 
Název
Vložil
Vloženo
Práva
Archiv závěrečné práce Mwanahamisi Issa Mapua PřF N-BI BISE (Z) tp2or/5
Mapua, M.
17. 5. 2011
  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.