Úkolem studenta je prostudovat aktuální možnosti vývoje mobilních aplikací pro vizualizaci molekul a poté navrhnout a implementovat vlastní aplikaci, která bude sloužit k zobrazení a základnímu prozkoumání proteinových struktur a jejich tunelů. Aplikace bude navržena pro platformu Android a bude optimalizována na tablety. Aplikace umožní základní transformační operace s načtenou molekulou, dále pak změnu způsobu vykreslení dle tradičně používaných metod a změnu použitého barevného schématu pro jednotlivé typy atomů. Další podporovanou funkcionalitou bude možnost načtení a vizualizace tunelů v proteinech, které byly předem spočteny pomocí nástroje CAVER. Pro lepší orientaci uživatele v molekule bude podporováno i zobrazení sekvenční informace o proteinovém řetězci, včetně možnosti interaktivní selekce jednotlivých aminokyselin, které se automaticky zvýrazní rovněž v prostorové reprezentaci molekuly. V textové části student popíše aktuální stav v této oblasti a vhodné technologie a poté se zaměří na popis vlastního návrhu řešení a implementace.