Diplomová práce

Kvantitativní popis interakce telomerových proteinů a transkripčních faktorů

Quantitative description of interactions of telomere proteins and transcription factors

Bc. Eliška Kůřilová
Anotace

Virus Epstein-Barrové (EBV) je původcem infekční mononukleózy, avšak jako onkogen způsobuje až 1,5 % nádorových onemocnění ročně. V infikovaných buňkách se EBV nachází ve dvou fázích svého cyklu – lytické a latentní. Přechod viru mezi latentní a lytickou fází je spojován s transkripčním faktorem Rta (replication and transcription activator). Rta se na počátku lytického cyklu viru váže na krátkou konzervovanou …více

Abstract

Epstein-Barr virus (EBV) is the cause of infectious mononucleosis, but as an oncogene it causes up to 1.5% of cancers per year. In infected cells, EBV can persist in two phases - lytic and latent. The transition of the virus between the latent and lytic phases is associated with the transcription factor Rta (replication and transcription activator). At the early stage of the viral lytic cycle, Rta …více

Klíčová slova
Virus Epstein-Barrové Rta RRE fluorescenční mikroskopie gelová retardační analýza Epstein-Barr virus fluorescence microscopy electromobility shift assay
Zadání práce
Konce lidských chromozomů jsou chráněny nukleoproteinovými komplexy nazývanými telomery. Shelterin, jakožto esenciální proteinový komplex složený z šesti různých podjednotek, zabraňuje rozpoznání konců telomerové DNA jako dvourětězcový zlom. Tímto omezuje nechtěnou aktivitu buněčných reparačních mechanismů účastnících se při opravách DNA. Proteinové interakce v rámci shelterinového komplexu dynamicky ovlivňují stabilitu komplexu a hrají zásadní roli při zajištění ochrany telomer. Jednotlivé proteiny shelterinu mají také netelomerové funkce. Např. protein TRF2 interaguje s transkripčním faktorem REST a tím moduluje represi nervových genů, což má zásadní význam při diferenciaci nervových buněk, popřípadě vzniku nebo progresi glioblastomu – nejmalignějšího nádoru mozku. V rámci práce budou studovány dynamické vazby v rámci shelterinového komplexu a vazby s dalšími proteiny podílející se na regulaci transkripce. Tyto poznatky budou využity při návrhu nových postupů pro cílené snížení viability nádorových buněk. Cíle práce: - Připravit a purifikovat proteiny pro následnou kvantitativní analýzu. - Studovat interakce proteinů lidského shelterinu a transkripčních faktorů. - Kvalitativně a kvantitativně charakterizovat interakce kombinací biochemických technik a metod molekulární biologie. Jazyk závěrečné práce: čeština
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
22. 5. 2022 14:28, doc. Mgr. Ctirad Hofr, Ph.D., učo 7807
Plný text práce
1,6 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
20. 6. 2022
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. Mgr. Ctirad Hofr, Ph.D., učo 7807
NCBR PřF MU

Oponent

Mgr. Barbora Štefanovie, Ph.D., učo 142123
NCBR PřF MU

Konzultant

Ing. Tomáš Janovič, Ph.D., učo 366321
NCBR PřF MU

Literatura

  • JANOVIČ, Tomáš; Martin STOJASPAL; Pavel VEVERKA; Denisa HORÁKOVÁ a Ctirad HOFR. Human Telomere Repeat Binding Factor TRF1 Replaces TRF2 Bound to Shelterin Core Hub TIN2 when TPP1 Is Absent. Journal of Molecular Biology. London: ACADEMIC PRESS LTD- ELSEVIER SCIENCE LTD, 2019, roč. 431, č. 17, s. 3289-3301. ISSN 0022-2836. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.jmb.2019.05.038.
  • VEVERKA, Pavel; Tomáš JANOVIČ a Ctirad HOFR. Quantitative Biology of Human Shelterin and Telomerase: Searching for the Weakest Point. International Journal of Molecular Sciences. Basel: Multidisciplinary Digital Publishing Institute, 2019, roč. 20, č. 13, s. 1-13. ISSN 1422-0067. Dostupné z: https://doi.org/10.3390/ijms20133186.
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Genomika a Proteomika

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.