Diplomová práce

Genotypizace biomarkerů pro léčbu thiopuriny na bázi rychlého masivně paralelního sekvenování

Genotyping of biomarkers for thiopurine therapy using rapid massively parallel sequencing

Bc. Tereza Vyhnalová
Anotace

Rozvoj nežádoucích účinků v důsledku léčby thiopuriny představuje problém, s kterým se celosvětově potýkají lékaři ve své klinické praxi. Část nežádoucích reakcí může být způsobena přítomností polymorfismů v genech TPMT, NUDT15, ITPA a PACSIN2. Byla zavedena metodika genotypizace vybraných polymorfismů v těchto genech pomocí rychlého masivně paralelního sekvenování. Metodika byla optimalizována a byla …více

Abstract

The development of adverse effects as a result of thiopurine treatment is a problem faced by physicians in their clinical practice worldwide. Some adverse reactions may occur due to the presence of polymorphisms in the TPMT, NUDT15, ITPA and PACSIN2 genes. A methodology has been established to enable genotyping of selected polymorphisms in these genes using rapid massively parallel sequencing. The …více

Zadání práce
Vypracováním teoretické části diplomové práce student prokáže schopnost orientovat se v tématu individualizace léčby thiopuriny na základě přítomnosti biomarkerů se zřetelem na pozdější návrh biotechnologického postupu výroby a kontroly kvality diagnostického kitu. Důraz v experimentální části je proto kladen na zavedení nových biotechnologií na bázi rychlého hlubokého sekvenování genů TPMT, ITPA, NUDT15 a PACSIN2, který může vylepšit nynější způsob diagnostiky. Student prokáže schopnost své výsledky aplikovat a zasadit do požadavků partnera ve výrobní a komerční biotechnologické sféře. Práce bude probíhat v spolupráci s firmou BioVendor - Laboratorní medicína a.s. v Brně, kde na základě průzkumu trhu byl identifikován potencionální prostor pro nový produkt. Cílem diplomové práce je navržení specifických primerů pro cílené biomarkery, vývoj a optimalizace nových metod a kitů na principu technologie fastGEN, kterou má firma licencovanou. Nedílnou součástí práce bude validace výsledků a jejich translace do návrhu postupu biotechnologické výroby kitu ve firmě BioVendor
Práce zkontrolována:
22. 5. 2023 08:25, Ing. Rastislav Slavkovský, Ph.D.
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
28. 6. 2023
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Ing. Rastislav Slavkovský, Ph.D.

Oponent

Mgr. Zuzana Rožánková, Ph.D.
LF UPOL

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.