Diplomová práce

Using machine learning methods for predicting results of MammaPrint and Luminal-Type Tests

Bc. Oliver Rainoch
Anotace

Strojové učení ve spojení s digitální patologií nabízí významný potenciál pro predikci výsledků diagnostických testů v onkologii. S ohledem na omezenou dostupnost podrobných anotací nádorů se tato práce zaměřila na predikci diagnostických informací přímo ze snímků histopatologických vzorků. Použité datové sady zahrnovaly výsledky testů MammaPrint a BluePrint, které umožňují klasifikaci podtypů a molekulární …více

Abstract

Machine learning combined with digital pathology offers significant potential for predicting the outcomes of diagnostic tests in oncology. Given the limited availability of detailed tumor annotations, this study focused on predicting diagnostic information directly from histopathological sample images. The datasets used included results from the MammaPrint and BluePrint tests, which enable the classification …více

Klíčová slova
machine learning digital pathology multiple instance learning breast cancer RationAI
Zadání práce
The thesis aims to develop algorithms for predicting test results of MammaPrint and Luminal-Type from the microscopic images of tissue. The thesis should survey existing methods for solving similar problems from digital pathology using deep learning methods. In the practical part, the student will implement several selected methods and compare them w.r.t. the quality of predictions. Moreover, the student will apply suitable methods for explaining trained models and, in cooperation with pathologists, will try to identify morphological elements related to the solution of the pathology problems.

All work will be done in collaboration with pathologists from Masaryk Memorial Cancer Institute. The data will also be provided by MMCI.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
23. 12. 2024 09:25, doc. RNDr. Tomáš Brázdil, Ph.D., MBA, učo 4074
Plný text práce
22,4 MB / soubor PDF
Přílohy (1)
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
30. 1. 2025
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. RNDr. Tomáš Brázdil, Ph.D., MBA, učo 4074
KSUZD FI MU

Oponent

doc. RNDr. Petr Novotný, Ph.D., učo 172743
KTP FI MU

Konzultant

RNDr. Vít Musil, Ph.D., učo 246021
KTP FI MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Fakulta informatiky
Studijní program
Plán
Návrh a vývoj softwarových systémů

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.